229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4503 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4503  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  556  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  59.64 
 
 
306 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  57.5 
 
 
283 aa  329  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  54.42 
 
 
287 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  51.79 
 
 
283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3655  UspA domain protein  53.21 
 
 
283 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00313868  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2454  UspA domain protein  53.21 
 
 
283 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  51.96 
 
 
306 aa  296  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0473  hypothetical protein  40.93 
 
 
282 aa  228  9e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.203309  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  40.93 
 
 
282 aa  224  9e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  23.83 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  21.67 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  22.74 
 
 
320 aa  62.4  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 
138 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  27.86 
 
 
140 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  23.43 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 
138 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  20.07 
 
 
296 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  25.32 
 
 
305 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  19.87 
 
 
291 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  29.5 
 
 
152 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  29.5 
 
 
152 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  29.5 
 
 
152 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  29.5 
 
 
152 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  29.5 
 
 
152 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  29.5 
 
 
152 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  32.97 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  29.5 
 
 
152 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  22.56 
 
 
280 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  29.5 
 
 
152 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  29.5 
 
 
152 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  26.81 
 
 
140 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 
152 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 
152 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  47.54 
 
 
160 aa  57  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  25.93 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  27.66 
 
 
142 aa  56.6  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  26.95 
 
 
139 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  29.29 
 
 
141 aa  56.2  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  30.5 
 
 
141 aa  56.2  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  28.86 
 
 
148 aa  55.8  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  33.94 
 
 
150 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 
140 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  24.86 
 
 
180 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
138 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  25.52 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
141 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  28.67 
 
 
143 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  23.03 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.33 
 
 
128 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  26.06 
 
 
148 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  30.37 
 
 
142 aa  52.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  43.86 
 
 
141 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.5 
 
 
139 aa  52.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  27.03 
 
 
173 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  26.11 
 
 
162 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  30.22 
 
 
140 aa  52.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  22.78 
 
 
303 aa  52.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  25.53 
 
 
297 aa  52.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  31.65 
 
 
151 aa  52.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3020  putative universal stress protein Usp  27.54 
 
 
140 aa  52.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.680778  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  25.35 
 
 
158 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  23.75 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  30.71 
 
 
140 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  33.78 
 
 
145 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  28.99 
 
 
140 aa  50.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  22.63 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 
140 aa  50.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  27.27 
 
 
142 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  23.38 
 
 
305 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  32.22 
 
 
147 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  36.78 
 
 
325 aa  49.7  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  26.28 
 
 
154 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  22.14 
 
 
307 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  33.04 
 
 
154 aa  49.3  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2814  UspA domain protein  31.39 
 
 
148 aa  49.3  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000545655  hitchhiker  0.00186691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  41.51 
 
 
164 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  23.86 
 
 
291 aa  49.3  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  41.51 
 
 
164 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
144 aa  49.3  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.01 
 
 
141 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  24.14 
 
 
145 aa  48.9  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  18.97 
 
 
288 aa  48.9  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  37.18 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  21.85 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  27.94 
 
 
137 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3375  hypothetical protein  31.91 
 
 
136 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  21.67 
 
 
314 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 
142 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  26.19 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 
138 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  27.54 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1115  hypothetical protein  27.48 
 
 
126 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.198517  normal  0.698975 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  24.7 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  23.94 
 
 
151 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  25.16 
 
 
167 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  27.14 
 
 
140 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  24.49 
 
 
155 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  25 
 
 
160 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0533854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>