196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4498 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  62.35 
 
 		 1012 aa  1027    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  82.06 
 
 		 1118 aa  1566    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  82.79 
 
 		 1113 aa  1567    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  82.23 
 
 		 1340 aa  1760    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  79.8 
 
 		 889 aa  1342    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  58.3 
 
 		 2194 aa  758    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.86 
 
 		 1009 aa  716    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  86.86 
 
 		 1222 aa  2066    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 1225 aa  2434    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.42 
 
 		 891 aa  594  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  56.37 
 
 		 1019 aa  345  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.53 
 
 		 1800 aa  324  7e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.22 
 
 		 1661 aa  259  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  43.35 
 
 		 1838 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.2 
 
 		 1269 aa  246  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.73 
 
 		 1269 aa  243  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  28.69 
 
 		 1029 aa  238  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  43.14 
 
 		 1037 aa  237  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.64 
 
 		 1029 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  31.21 
 
 		 2310 aa  228  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  38.24 
 
 		 2807 aa  222  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  31.26 
 
 		 2305 aa  221  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  41.24 
 
 		 828 aa  211  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  42.9 
 
 		 412 aa  209  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  35.37 
 
 		 1557 aa  209  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  42.06 
 
 		 386 aa  202  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.67 
 
 		 928 aa  196  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  27.74 
 
 		 5899 aa  178  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  38.32 
 
 		 974 aa  175  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  41.12 
 
 		 1490 aa  175  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  39.14 
 
 		 872 aa  171  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  39.6 
 
 		 604 aa  167  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  36.94 
 
 		 644 aa  166  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.49 
 
 		 3396 aa  163  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  40.79 
 
 		 662 aa  162  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  33.14 
 
 		 554 aa  162  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  38.64 
 
 		 1126 aa  160  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  38.67 
 
 		 813 aa  158  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.46 
 
 		 768 aa  153  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  35.69 
 
 		 1289 aa  152  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  27.71 
 
 		 4379 aa  148  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  39.77 
 
 		 1275 aa  148  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.56 
 
 		 1415 aa  135  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  28.81 
 
 		 4013 aa  132  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  34.04 
 
 		 616 aa  131  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  34.39 
 
 		 472 aa  127  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  32.43 
 
 		 469 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  25.8 
 
 		 2127 aa  102  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  32.82 
 
 		 657 aa  100  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30 
 
 		 1180 aa  98.2  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 3197 aa  93.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  37.77 
 
 		 663 aa  92  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  26.23 
 
 		 2042 aa  91.7  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.32 
 
 		 3168 aa  88.2  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  47.79 
 
 		 161 aa  87.8  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  35.71 
 
 		 7149 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  35.5 
 
 		 5444 aa  87  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.95 
 
 		 3197 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  32.19 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  31.73 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.92 
 
 		 8871 aa  84  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2106  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1058 aa  84  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.866139  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  42.06 
 
 		 2632 aa  82.8  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  30.82 
 
 		 685 aa  82.8  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.71 
 
 		 647 aa  82.4  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  25.7 
 
 		 4848 aa  82.4  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  35.51 
 
 		 894 aa  82.4  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  36.61 
 
 		 863 aa  80.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0736  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.52 
 
 		 1021 aa  77.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  35.75 
 
 		 837 aa  75.1  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  32.71 
 
 		 894 aa  74.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  38.89 
 
 		 1594 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  38.53 
 
 		 1156 aa  73.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  37.04 
 
 		 2334 aa  72.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5616  hypothetical protein  33.13 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  29.25 
 
 		 1124 aa  72.4  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  28.93 
 
 		 1527 aa  72.4  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.65 
 
 		 5098 aa  72.4  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1638 aa  72.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.17 
 
 		 11716 aa  71.6  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.43 
 
 		 547 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  28.01 
 
 		 917 aa  70.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  24.07 
 
 		 1031 aa  68.9  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3672  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.35 
 
 		 255 aa  69.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.33 
 
 		 959 aa  68.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  38.32 
 
 		 715 aa  68.2  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  32 
 
 		 2796 aa  66.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  31.86 
 
 		 1022 aa  65.1  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.03 
 
 		 1091 aa  63.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29131  hypothetical protein  45.95 
 
 		 934 aa  62.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  23.87 
 
 		 615 aa  61.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  30 
 
 		 1053 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  33.94 
 
 		 16311 aa  59.7  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  31.9 
 
 		 456 aa  60.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  30.32 
 
 		 510 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  28.53 
 
 		 690 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  27.95 
 
 		 1328 aa  59.3  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3628  FG-GAP repeat protein  25.22 
 
 		 829 aa  58.9  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  39.64 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  30.25 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>