More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4491 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  72.93 
 
 		 231 aa  349  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.13 
 
 		 226 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  69.87 
 
 		 231 aa  332  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  70.93 
 
 		 231 aa  330  8e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  70.93 
 
 		 231 aa  330  8e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  72.12 
 
 		 231 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  67.11 
 
 		 235 aa  318  3.9999999999999996e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  60.35 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  59.73 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  58.22 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  58.22 
 
 		 245 aa  259  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  54.87 
 
 		 242 aa  254  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  56.33 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  54.87 
 
 		 242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  54.87 
 
 		 242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  57.26 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.58 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.25 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  43.11 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.41 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 227 aa  180  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.65 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.65 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 225 aa  169  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.46 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 217 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45539  diatom response regulator 1  36.48 
 
 		 319 aa  156  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11994  diatom response regulator 2  36.17 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  35.36 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  33.49 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  31.96 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  40 
 
 		 170 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  36.26 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  36.31 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  36.31 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  36.31 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  36.31 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  37.08 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  36.31 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  36.31 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  35.64 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  46.55 
 
 		 1172 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.39 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  34.97 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  46.62 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  35.39 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0209  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.49 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.17 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  30.59 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.07 
 
 		 326 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5387  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.39 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  41.41 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0852  two component transcriptional regulator  43.2 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0690944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  38.51 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  43.22 
 
 		 326 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  35.2 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  32.46 
 
 		 236 aa  106  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  34.56 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.87 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03275  two-component system, transcriptional regulatory protein  35.81 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3460  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0108229  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  41.04 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  34.59 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  33.52 
 
 		 233 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.04 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  35.4 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  34.78 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  34.56 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  34.05 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.75 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  36.46 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  41.04 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  33.62 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0648  diguanylate phosphodiesterase  37.93 
 
 		 403 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  34.56 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.31 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  33.77 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2022  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.4 
 
 		 589 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  31.56 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>