More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4470 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4470  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 360 aa  731    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17521  GIC family ligand gated channel  45.76 
 
 		 333 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0766  ionotropic glutamate receptor  41.42 
 
 		 357 aa  283  4.0000000000000003e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3401  extracellular solute-binding protein family 3  39.34 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2108  Ion transport 2 domain protein  33.03 
 
 		 380 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.64507  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3185  extracellular solute-binding protein family 3  30.95 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0319469  normal  0.327167 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0534  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 378 aa  146  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000119937  normal  0.231064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0989  ionotropic glutamate receptor  27.65 
 
 		 385 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00799659  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0243  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.461233  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4522  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5634  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2561  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1963  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.503489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2998  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.593817  normal  0.519466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4230  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.062377 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06570  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  23.84 
 
 		 363 aa  96.3  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3087  extracellular solute-binding protein  20.18 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1231  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.196544  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  38.61 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  37.62 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  34.19 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  28.45 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  39.77 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  35.64 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  44.12 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  36.9 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  33.7 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1169  hypothetical protein  30.77 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242801  normal  0.430394 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  43.33 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  39.56 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0098  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.37 
 
 		 487 aa  56.2  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321849  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  33.33 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.42 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  30 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  36.17 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  35.48 
 
 		 231 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.49 
 
 		 244 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1920  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  35.51 
 
 		 252 aa  55.1  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.541755  hitchhiker  0.00384825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1556  Ion transport protein  41.67 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000506014  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  34.41 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  36.47 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1745  Ion transport 2 domain-containing protein  32.38 
 
 		 252 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  31.62 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  34.04 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  35.83 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 273 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  36.96 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  45 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  37.5 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2030  Ion transport protein  34.65 
 
 		 263 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 257 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0673  potassium channel protein  28.8 
 
 		 428 aa  53.9  0.000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0468102  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1082  putative potassium channel protein  31.06 
 
 		 280 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  38.04 
 
 		 261 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2446  Ion transport 2 domain protein  28.81 
 
 		 269 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  24.56 
 
 		 247 aa  53.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3664  Ion transport 2 domain protein  31.82 
 
 		 271 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  33.33 
 
 		 311 aa  53.5  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.98 
 
 		 272 aa  53.5  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  30.11 
 
 		 267 aa  53.5  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.7 
 
 		 278 aa  53.1  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  34.07 
 
 		 272 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  33.7 
 
 		 269 aa  53.1  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  36.96 
 
 		 250 aa  53.1  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  32.98 
 
 		 266 aa  53.1  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 253 aa  52.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0094  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.19 
 
 		 300 aa  52.8  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.546217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  28.16 
 
 		 269 aa  52.8  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4365  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  26.21 
 
 		 517 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0287  hypothetical protein  46.77 
 
 		 231 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.9 
 
 		 267 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  41.77 
 
 		 269 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00865  hypothetical protein  33.67 
 
 		 272 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.08 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0132  VIC family potassium channel protein  35.29 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0238536  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  28.89 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 270 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2760  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.08 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1345  CjaC  34.29 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000213382  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0716  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 272 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 244 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  29.52 
 
 		 242 aa  51.6  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5008  Ion transport 2 domain-containing protein  31.37 
 
 		 251 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 242 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  34.09 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  27.96 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  37.97 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  51.28 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2022  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.72 
 
 		 748 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  28.89 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>