202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4460 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  44.53 
 
 
1219 aa  992    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  90.1 
 
 
1779 aa  1772    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  70.08 
 
 
1321 aa  819    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  57.93 
 
 
1711 aa  1018    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  74.78 
 
 
1083 aa  713    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  48.04 
 
 
1448 aa  776    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1247 aa  2553    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  72.1 
 
 
1621 aa  993    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  84.03 
 
 
1544 aa  912    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  40.11 
 
 
994 aa  527  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  31.3 
 
 
992 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  48.34 
 
 
552 aa  364  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  43.8 
 
 
393 aa  313  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  37.41 
 
 
1911 aa  249  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  39.46 
 
 
724 aa  244  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  26.69 
 
 
1266 aa  237  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  32.14 
 
 
934 aa  216  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  35.84 
 
 
422 aa  215  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  32.1 
 
 
982 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  36.02 
 
 
1141 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.27 
 
 
1007 aa  186  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  40.3 
 
 
596 aa  184  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  36.3 
 
 
599 aa  183  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 
1276 aa  160  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
916 aa  155  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 
1192 aa  154  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.25 
 
 
1276 aa  148  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  35.39 
 
 
714 aa  140  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.574809 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  32.74 
 
 
1288 aa  139  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  24.67 
 
 
1058 aa  139  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  38.56 
 
 
1502 aa  139  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  27.54 
 
 
565 aa  138  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
878 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  31.32 
 
 
720 aa  126  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 
1694 aa  125  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 
1869 aa  124  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.85 
 
 
810 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  34.21 
 
 
476 aa  122  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  25.45 
 
 
962 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  28.83 
 
 
827 aa  115  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  23.01 
 
 
1051 aa  114  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  30.39 
 
 
737 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0606  hypothetical protein  37.28 
 
 
199 aa  112  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  28.1 
 
 
985 aa  108  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  34.46 
 
 
720 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.92 
 
 
2741 aa  106  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  23.95 
 
 
1476 aa  103  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.79 
 
 
2741 aa  103  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  25.67 
 
 
521 aa  102  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  30.07 
 
 
717 aa  97.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.12 
 
 
1162 aa  95.1  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 
949 aa  93.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  34.27 
 
 
1131 aa  93.2  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 
1450 aa  93.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 
1060 aa  92.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.84 
 
 
733 aa  92.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
1162 aa  91.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  33.18 
 
 
326 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 
1215 aa  90.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.48 
 
 
991 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.46 
 
 
644 aa  89.4  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  31.42 
 
 
322 aa  89  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  31.42 
 
 
322 aa  89  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
729 aa  86.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  32.27 
 
 
325 aa  86.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  31.43 
 
 
560 aa  86.7  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
868 aa  85.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  35.2 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25.33 
 
 
725 aa  84  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  28.83 
 
 
490 aa  83.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.13 
 
 
1186 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  25.84 
 
 
1507 aa  79.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  36.02 
 
 
326 aa  79  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  36.02 
 
 
326 aa  79  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.58 
 
 
991 aa  78.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  29.73 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  29.96 
 
 
327 aa  77.8  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 
649 aa  77.8  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  19.89 
 
 
923 aa  77.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 
412 aa  74.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  21.49 
 
 
903 aa  73.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  35.76 
 
 
337 aa  72.8  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  27.8 
 
 
460 aa  72.8  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 
1363 aa  72.4  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
843 aa  72  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 
454 aa  70.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 
937 aa  70.1  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  30.43 
 
 
332 aa  68.9  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  41 
 
 
1054 aa  68.6  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  25.19 
 
 
832 aa  68.2  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  29.49 
 
 
325 aa  68.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.43 
 
 
828 aa  67.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 
846 aa  66.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  25.1 
 
 
1142 aa  66.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  35.59 
 
 
501 aa  66.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.63 
 
 
1328 aa  66.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.99 
 
 
767 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.08 
 
 
1238 aa  63.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  31.61 
 
 
405 aa  63.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  21.69 
 
 
854 aa  63.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>