41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4444 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4444  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  225  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1494  XRE family transcriptional regulator  74.12 
 
 		 96 aa  140  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0229  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.790112  hitchhiker  0.00100096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3537  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0304  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.397119  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3684  hypothetical protein  42.86 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0763  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.042345  normal  0.213229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3898  helix-turn-helix domain-containing protein  38.78 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0552  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.162215  hitchhiker  0.0000852105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1184  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0597  hypothetical protein  44.9 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0529458  normal  0.609091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2433  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.40389  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3065  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0653  XRE family transcriptional regulator  34 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4706  helix-turn-helix domain-containing protein  39.22 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4293  transcriptional regulator, XRE family  51.52 
 
 		 239 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 312 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  34.48 
 
 		 338 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  31.34 
 
 		 243 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1042  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.729396 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 362 aa  41.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3172  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 94 aa  40.8  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1198  Cro/CI family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1572  helix-turn-helix domain-containing protein  40.82 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328104  normal  0.0948744 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5021  XRE family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  30.77 
 
 		 227 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1531  XRE family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000256618  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0283  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2202  helix-turn-helix domain-containing protein  34 
 
 		 98 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.119587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3572  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 261 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  32.58 
 
 		 240 aa  40.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0269  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.506568  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  34.52 
 
 		 291 aa  40  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  42.42 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0928  hypothetical protein  37.78 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.729389  normal  0.315243 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1709  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 130 aa  40  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.105629  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 108 aa  40  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1708  transcriptional regulator, XRE family  32.08 
 
 		 102 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1248  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 109 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000139831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>