41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4363 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1102    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  29.91 
 
 
1238 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.04 
 
 
943 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  26.57 
 
 
496 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  28.53 
 
 
689 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  25.32 
 
 
697 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  27.03 
 
 
1689 aa  98.2  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 
1958 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 
1313 aa  94  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2132  hypothetical protein  28.09 
 
 
699 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.565923  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
1298 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  23.68 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
1101 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 
1285 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3408  heat repeat-containing PBS lyase  26.74 
 
 
1203 aa  73.6  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.539879 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
1063 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  25.81 
 
 
823 aa  70.5  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  22.4 
 
 
467 aa  66.6  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  24.23 
 
 
835 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  22.56 
 
 
806 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.638928 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2711  FHA domain-containing protein  22.91 
 
 
544 aa  58.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  34.03 
 
 
689 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
1526 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3350  GUN4-like  25 
 
 
979 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0305  FHA domain-containing protein  26.07 
 
 
525 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2611  hypothetical protein  47.76 
 
 
87 aa  53.5  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.735379  normal  0.540073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3868  Tetratricopeptide TPR_4  33.61 
 
 
1736 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0314468 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  26.98 
 
 
534 aa  50.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2610  hypothetical protein  28.57 
 
 
120 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.577355  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2709  FHA domain containing protein  29.86 
 
 
562 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3407  FHA domain containing protein  29.86 
 
 
562 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1258  polysaccharide deacetylase  24.31 
 
 
699 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252566  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0984  hypothetical protein  22.91 
 
 
413 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0503  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 
705 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  26.09 
 
 
1429 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2076  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  23.91 
 
 
661 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.445606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  32.69 
 
 
1914 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0047  hypothetical protein  22.57 
 
 
489 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  24.48 
 
 
504 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  29.45 
 
 
1104 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  25.94 
 
 
1020 aa  43.5  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>