149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4315 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
378 aa  778    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  57.3 
 
 
384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  56.35 
 
 
369 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  54.4 
 
 
367 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  57.22 
 
 
376 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  29.7 
 
 
454 aa  156  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40135  predicted protein  26.22 
 
 
461 aa  116  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  28.53 
 
 
415 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  25.32 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  26.5 
 
 
400 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  25.42 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  26.69 
 
 
325 aa  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  24.5 
 
 
397 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  26.37 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  25.11 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  26.18 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  26.08 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  26.03 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  24.21 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03325  saccharopine dehydrogenase  22.28 
 
 
457 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  25.68 
 
 
398 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  23.77 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  23.92 
 
 
399 aa  77  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  27.5 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  25.11 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3682  hypothetical protein  30.59 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  22.68 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4779  saccharopine dehydrogenase  21.98 
 
 
553 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  25 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  24.68 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  24.57 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  23.99 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  22.84 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  21.18 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1797  hypothetical protein  23.28 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0455083  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  23.04 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2221  saccharopine dehydrogenase  23.02 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139161  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36377  predicted protein  24.23 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  21.17 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1973  Saccharopine dehydrogenase  26.62 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000865351  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  30.77 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  25.06 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  25.33 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  22.91 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  23.54 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5049  Saccharopine dehydrogenase  22.37 
 
 
554 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54900  hypothetical protein  22.08 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000637066  unclonable  7.39539e-22 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  21.63 
 
 
403 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  22.85 
 
 
401 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  22.77 
 
 
399 aa  63.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  24.55 
 
 
385 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  28.14 
 
 
403 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4536  saccharopine dehydrogenase  24.74 
 
 
557 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.802227  normal  0.151907 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  23.85 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  23.87 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  24.56 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  28.08 
 
 
360 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4996  Saccharopine dehydrogenase  24.61 
 
 
554 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693151  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  24.6 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  22.98 
 
 
401 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  23.23 
 
 
401 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  25.53 
 
 
401 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  28.06 
 
 
413 aa  60.5  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  24.11 
 
 
414 aa  60.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  28.06 
 
 
413 aa  60.8  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  22.47 
 
 
394 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0723  Saccharopine dehydrogenase  29.61 
 
 
574 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554623  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  27.74 
 
 
426 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  21.72 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  23.24 
 
 
527 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  23.46 
 
 
396 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  26.44 
 
 
412 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  28.67 
 
 
404 aa  57.4  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  27.22 
 
 
403 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.1 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1622  saccharopine dehydrogenase  25 
 
 
348 aa  57  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.871276  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  21.66 
 
 
387 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  21.43 
 
 
387 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  23.6 
 
 
414 aa  56.6  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54890  hypothetical protein  23.21 
 
 
634 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000285931  unclonable  1.9973799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  22.31 
 
 
394 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  22.31 
 
 
394 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  22.31 
 
 
394 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  25.84 
 
 
394 aa  56.2  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  22.31 
 
 
394 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  23.11 
 
 
401 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  28.3 
 
 
412 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  28.3 
 
 
412 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0384  Saccharopine dehydrogenase  29.88 
 
 
384 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0854083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  22.05 
 
 
394 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  23.97 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  22.05 
 
 
394 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  26.78 
 
 
413 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  23.65 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  24.41 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  21.21 
 
 
394 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1168  hypothetical protein  25.19 
 
 
202 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3964  Saccharopine dehydrogenase  28.21 
 
 
360 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  25.79 
 
 
351 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  21.78 
 
 
394 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>