51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4264 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  100 
 
 
627 aa  1287    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  57.53 
 
 
877 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  46.2 
 
 
520 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  52.54 
 
 
537 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  38.45 
 
 
623 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  54.05 
 
 
446 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  34.29 
 
 
638 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  50.76 
 
 
547 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  52.11 
 
 
456 aa  360  6e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  52.11 
 
 
456 aa  360  6e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  47.7 
 
 
384 aa  353  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  43.08 
 
 
456 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  43.08 
 
 
456 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  46.96 
 
 
457 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  50.63 
 
 
534 aa  337  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  45.65 
 
 
648 aa  334  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  48.21 
 
 
662 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  45.74 
 
 
456 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  47.53 
 
 
470 aa  323  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  44.12 
 
 
475 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  44.51 
 
 
405 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  43.05 
 
 
466 aa  317  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  43.88 
 
 
450 aa  309  8e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  42 
 
 
491 aa  293  6e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  31.99 
 
 
500 aa  231  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  39.09 
 
 
438 aa  230  7e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  32.69 
 
 
511 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  45.63 
 
 
117 aa  84.3  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  23.55 
 
 
902 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  23.55 
 
 
902 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1447  hypothetical protein  39.13 
 
 
129 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25.08 
 
 
1190 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  23.14 
 
 
891 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  22.82 
 
 
1214 aa  62.4  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  23.02 
 
 
781 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  22 
 
 
1914 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  21.5 
 
 
1367 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  24.19 
 
 
1908 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.77 
 
 
1163 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.32 
 
 
1161 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.32 
 
 
1161 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  21.01 
 
 
1932 aa  57  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  23.79 
 
 
1209 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 
335 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  31.37 
 
 
464 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  20.49 
 
 
2077 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  20.3 
 
 
1477 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  31.48 
 
 
544 aa  50.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  21.51 
 
 
787 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  19.28 
 
 
1164 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1649  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 
108 aa  45.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>