More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4229 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  58.31 
 
 
1390 aa  674    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.93 
 
 
1406 aa  822    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.18 
 
 
2037 aa  1098    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  66.04 
 
 
1917 aa  1130    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  64.7 
 
 
1782 aa  1170    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  67.88 
 
 
1588 aa  909    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  55.09 
 
 
1853 aa  1126    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4049  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.27 
 
 
1406 aa  717    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.57 
 
 
1303 aa  709    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  63.74 
 
 
1896 aa  1125    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  63.19 
 
 
1458 aa  942    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  69.82 
 
 
1468 aa  900    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.79 
 
 
2107 aa  1027    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  62.19 
 
 
1816 aa  1125    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  58.14 
 
 
2099 aa  1120    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  65.1 
 
 
1792 aa  1051    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  65.13 
 
 
1936 aa  1160    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  62.5 
 
 
1482 aa  824    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  64.36 
 
 
2010 aa  1124    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  66.71 
 
 
1857 aa  1082    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  65.67 
 
 
1937 aa  1168    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3894  putative sensor histidine kinase  64.65 
 
 
590 aa  663    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  55.6 
 
 
1843 aa  1122    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.77 
 
 
1400 aa  723    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  63.67 
 
 
1479 aa  1048    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  65.35 
 
 
1937 aa  1162    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  55.6 
 
 
1847 aa  1120    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  65.08 
 
 
1964 aa  1129    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  65.45 
 
 
1937 aa  1163    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.95 
 
 
2099 aa  1113    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  62.63 
 
 
1392 aa  842    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  66.71 
 
 
1839 aa  1082    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.55 
 
 
1954 aa  1117    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  65.81 
 
 
1942 aa  1192    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  70.7 
 
 
1695 aa  854    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
1150 aa  2236    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5202  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.06 
 
 
1478 aa  819    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0874625 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  58.94 
 
 
1297 aa  619  1e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4523  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.36 
 
 
1179 aa  596  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522992  decreased coverage  0.00180703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4103  ATPase domain-containing protein  58.94 
 
 
1179 aa  592  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.972573  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  57.43 
 
 
1214 aa  559  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  62.9 
 
 
1119 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  68.32 
 
 
1159 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  56.95 
 
 
1118 aa  472  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0951  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.2 
 
 
1332 aa  301  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.514754  normal  0.661078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.92 
 
 
858 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.05 
 
 
904 aa  294  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  62.08 
 
 
545 aa  294  9e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  49.58 
 
 
518 aa  280  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 
545 aa  265  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.25 
 
 
528 aa  251  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  52.28 
 
 
562 aa  251  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  59.49 
 
 
533 aa  249  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.36 
 
 
522 aa  250  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  52.9 
 
 
540 aa  250  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.04 
 
 
532 aa  249  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  54.44 
 
 
538 aa  249  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  54.07 
 
 
531 aa  248  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.04 
 
 
538 aa  248  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.74 
 
 
623 aa  248  6.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.86 
 
 
546 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.28 
 
 
394 aa  244  7e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  52.48 
 
 
542 aa  244  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.6 
 
 
538 aa  243  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.59 
 
 
537 aa  237  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  24.76 
 
 
1009 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0724205  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  50.72 
 
 
543 aa  234  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.58 
 
 
542 aa  234  7.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  53.26 
 
 
407 aa  233  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.2 
 
 
547 aa  232  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.94 
 
 
538 aa  231  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.22 
 
 
523 aa  231  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 
544 aa  230  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  47.77 
 
 
535 aa  228  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.17 
 
 
538 aa  228  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  57.61 
 
 
530 aa  228  7e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.37 
 
 
545 aa  227  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  45.11 
 
 
965 aa  226  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  48.04 
 
 
347 aa  226  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.2 
 
 
536 aa  224  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.34 
 
 
702 aa  221  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  55.6 
 
 
533 aa  219  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1248  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.05 
 
 
981 aa  219  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206477  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  49.63 
 
 
540 aa  218  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  49.47 
 
 
540 aa  212  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 
715 aa  211  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  55.7 
 
 
540 aa  207  9e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.95 
 
 
741 aa  207  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.6 
 
 
535 aa  207  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.67 
 
 
573 aa  206  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.75 
 
 
535 aa  206  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.29 
 
 
731 aa  205  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.26 
 
 
531 aa  205  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1783  chemotaxis sensory transducer  48.02 
 
 
515 aa  201  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552405  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.78 
 
 
655 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.52 
 
 
529 aa  200  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  21.94 
 
 
1355 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.22 
 
 
563 aa  199  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  47.6 
 
 
688 aa  199  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
567 aa  199  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>