More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4192 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
1287 aa  2450    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  38.51 
 
 
982 aa  558  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  46.63 
 
 
2145 aa  244  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  39.95 
 
 
393 aa  186  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  46.18 
 
 
2954 aa  184  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  43.63 
 
 
946 aa  183  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.49 
 
 
1795 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.88 
 
 
980 aa  182  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  42.11 
 
 
2105 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 
9867 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  40.13 
 
 
1164 aa  177  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  31.11 
 
 
1532 aa  173  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.79 
 
 
3427 aa  167  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  42.11 
 
 
1534 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.09 
 
 
2668 aa  164  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  45.42 
 
 
595 aa  163  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  36.58 
 
 
1279 aa  160  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  43.27 
 
 
491 aa  160  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  40.22 
 
 
3954 aa  160  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  44.49 
 
 
613 aa  159  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  46.38 
 
 
460 aa  157  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  43.67 
 
 
615 aa  157  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  38.23 
 
 
526 aa  156  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  41.96 
 
 
1424 aa  154  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  43.61 
 
 
1400 aa  154  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  42.69 
 
 
1363 aa  152  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  36.19 
 
 
2689 aa  151  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  40.21 
 
 
387 aa  151  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  41.61 
 
 
387 aa  151  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.39 
 
 
2678 aa  149  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  42.56 
 
 
589 aa  149  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  46.85 
 
 
1895 aa  148  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  45.16 
 
 
5171 aa  148  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  44.26 
 
 
833 aa  148  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  39.75 
 
 
341 aa  145  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  41.97 
 
 
965 aa  144  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  43.25 
 
 
4334 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.41 
 
 
588 aa  142  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  34.39 
 
 
795 aa  142  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.35 
 
 
1236 aa  141  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  33.53 
 
 
709 aa  141  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  40 
 
 
460 aa  140  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  35.49 
 
 
3619 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  37.96 
 
 
1855 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  35.84 
 
 
3619 aa  138  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  36.91 
 
 
437 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.5 
 
 
2667 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.33 
 
 
1963 aa  137  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  36.04 
 
 
4687 aa  136  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  36.22 
 
 
437 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  36.71 
 
 
4800 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  33.98 
 
 
1156 aa  135  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  38.56 
 
 
341 aa  134  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  41.57 
 
 
950 aa  134  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  40.53 
 
 
363 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  41.94 
 
 
1544 aa  133  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  38.81 
 
 
824 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  38.69 
 
 
2775 aa  131  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  37.94 
 
 
424 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  32.51 
 
 
1499 aa  130  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  36.12 
 
 
396 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  44.04 
 
 
813 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  34.94 
 
 
3209 aa  129  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.55 
 
 
2346 aa  129  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  39.78 
 
 
769 aa  129  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  34.72 
 
 
3608 aa  128  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  36.88 
 
 
1043 aa  128  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  34.99 
 
 
556 aa  127  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  42.34 
 
 
1712 aa  125  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  36.79 
 
 
850 aa  125  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.03 
 
 
1016 aa  125  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  34.36 
 
 
518 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  41.74 
 
 
1883 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  38.06 
 
 
724 aa  122  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  38.35 
 
 
757 aa  122  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  36.42 
 
 
1079 aa  122  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  41.58 
 
 
361 aa  121  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  42.86 
 
 
606 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  39.64 
 
 
736 aa  120  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  40.89 
 
 
639 aa  119  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  39.46 
 
 
327 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  26.8 
 
 
2836 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  36.59 
 
 
355 aa  119  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  35.26 
 
 
357 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  48.32 
 
 
686 aa  118  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  39.91 
 
 
938 aa  117  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  43.72 
 
 
260 aa  117  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  38.66 
 
 
561 aa  116  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1287  VCBS  39.85 
 
 
610 aa  116  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.535504  normal  0.448224 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  33.91 
 
 
2911 aa  116  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  33.81 
 
 
1884 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2816  hemolysin-type calcium-binding region  32.72 
 
 
351 aa  114  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  36.22 
 
 
385 aa  114  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  41.75 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  43.16 
 
 
361 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  37.19 
 
 
728 aa  114  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  43.16 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  43.51 
 
 
421 aa  112  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  40.67 
 
 
744 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  47.65 
 
 
679 aa  112  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>