197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4068 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4068  O-succinylbenzoate synthase  100 
 
 
314 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000591111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2635  O-succinylbenzoate synthase  57.59 
 
 
320 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  55.63 
 
 
305 aa  353  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  52.08 
 
 
322 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.65 
 
 
309 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  51.76 
 
 
322 aa  308  8e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0918  O-succinylbenzoate synthase  48.56 
 
 
315 aa  292  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2806  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 
363 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1020  O-succinylbenzoate synthase  38.01 
 
 
316 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.689841  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  27.7 
 
 
322 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.925844  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2118  putative O-succinylbenzoate synthase  29.53 
 
 
323 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.946546  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1543  O-succinylbenzoate-CoA synthase  27.85 
 
 
323 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.324734  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02501  putative O-succinylbenzoate synthase  28.43 
 
 
323 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27331  putative O-succinylbenzoate synthase  27.34 
 
 
322 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.89 
 
 
365 aa  89.4  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.11 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2437  putative O-succinylbenzoate synthase  31.87 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  29.49 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  26.23 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.16 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.67 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.37 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4606  N-acylamino acid racemase; O-succinylbenzoate synthase  25.9 
 
 
368 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.820644  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  25.72 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  26.23 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  26.23 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  25.66 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4746  N-acylamino acid racemase  25.9 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5107  N-acylamino acid racemase  25.9 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.09 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.78 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01931  putative O-succinylbenzoate synthase  24.83 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  26.42 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  24.92 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.57 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02041  putative O-succinylbenzoate synthase  26.51 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01951  putative O-succinylbenzoate synthase  24.83 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0177  putative O-succinylbenzoate synthase  26.82 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.236864  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.89 
 
 
357 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  24.67 
 
 
368 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  23.91 
 
 
356 aa  65.1  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.05 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0655  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.43 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.22 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2001  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  20.72 
 
 
368 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.974655 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1603  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.36 
 
 
341 aa  63.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.929167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2610  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.2 
 
 
350 aa  63.2  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.562988  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0769  O-succinylbenzoate synthase  25.83 
 
 
370 aa  63.2  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  27.64 
 
 
324 aa  62.4  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  25.76 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.86 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4404  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  23.55 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1855  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  25.51 
 
 
376 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2645  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.33 
 
 
369 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1544  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.26 
 
 
391 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155525 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.13 
 
 
350 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2856  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.67 
 
 
350 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193797 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2578  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  25.67 
 
 
350 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.15317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.92 
 
 
368 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.165898 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2898  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.67 
 
 
350 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.95 
 
 
366 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.75 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1174  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.79 
 
 
369 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00378756 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.08 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.75 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1934  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.94 
 
 
355 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.75 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.75 
 
 
369 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  22.36 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0055  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.53 
 
 
343 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.726209  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1931  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  19.43 
 
 
366 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2659  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.2 
 
 
350 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2850  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  26.2 
 
 
350 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1295  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  18.47 
 
 
367 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.515012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.75 
 
 
369 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.1 
 
 
369 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  21.43 
 
 
369 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.1 
 
 
369 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.37 
 
 
366 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.87 
 
 
355 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2652  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.68 
 
 
350 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.59335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2431  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.14 
 
 
353 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.784789 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3658  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  20.66 
 
 
360 aa  56.2  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3758  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.84 
 
 
367 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379119  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  27.07 
 
 
364 aa  55.8  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3171  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.88 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3234  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.04 
 
 
370 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  25.29 
 
 
367 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2863  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  25.14 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.37 
 
 
388 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  29.38 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04247  chloromuconate cycloisomerase  21.21 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3832  o-succinylbenzoate synthase  22.03 
 
 
370 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5268  O-succinylbenzoate synthase  25.84 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90998  normal  0.832208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.12 
 
 
369 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  20.9 
 
 
368 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0971  O-succinylbenzoate synthase  25.11 
 
 
346 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0308  O-succinylbenzoate synthase  26.74 
 
 
364 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  26.36 
 
 
366 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1716  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  20.74 
 
 
375 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>