More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4032 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2853  TrkA-N  60.18 
 
 
561 aa  683    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2794  TrkA-N domain protein  56.48 
 
 
568 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  100 
 
 
565 aa  1154    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3306  TrkA-N domain protein  56.31 
 
 
568 aa  689    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.484589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3105  TrkA-N  25.87 
 
 
683 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.716552 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2939  TrkA-N  25.4 
 
 
749 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0022  TrkA-N domain-containing protein  28.74 
 
 
553 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.377987  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0283  TrkA domain-containing protein  28.77 
 
 
639 aa  124  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244298  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2117  TrkA-N domain protein  25.74 
 
 
569 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4477  TrkA-N domain protein  24.8 
 
 
676 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4414  TrkA-N domain protein  24.8 
 
 
676 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4226  TrkA-N domain protein  23.09 
 
 
682 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0242  TrkA domain-containing protein  31.22 
 
 
668 aa  96.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  33.18 
 
 
359 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4290  TrkA domain-containing protein  37.39 
 
 
606 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  decreased coverage  0.00534263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  38.39 
 
 
605 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  26.8 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 
341 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.67 
 
 
347 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  28.91 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  30.29 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26.15 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  34.85 
 
 
565 aa  80.9  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  30.29 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  28.72 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  27.8 
 
 
351 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  28.39 
 
 
346 aa  79  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  31.07 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  27.96 
 
 
350 aa  77  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  25.9 
 
 
350 aa  77  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  29.5 
 
 
332 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  26.67 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  30.52 
 
 
338 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  25.95 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  29.14 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  24.12 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  42.11 
 
 
325 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  26.51 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  30.28 
 
 
355 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  28.64 
 
 
324 aa  72  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  28.77 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  25.7 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  25.08 
 
 
345 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  25.08 
 
 
339 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  23.33 
 
 
330 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  24.46 
 
 
346 aa  70.1  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  24.63 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  28.45 
 
 
337 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  28.31 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  33.66 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  33.66 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  33.66 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  36.36 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  33.66 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  27.37 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  24.88 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  28.65 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  24.75 
 
 
334 aa  67  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  24.75 
 
 
334 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  26.52 
 
 
384 aa  67  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  24.75 
 
 
330 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  22.53 
 
 
330 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  31.62 
 
 
352 aa  66.6  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  34.29 
 
 
564 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  24.14 
 
 
330 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  25.65 
 
 
336 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  37.86 
 
 
351 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  38.38 
 
 
251 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  31.62 
 
 
346 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  25.74 
 
 
335 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0848  TrkA-N  32.8 
 
 
347 aa  65.1  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0423628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25.6 
 
 
355 aa  64.7  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  31.62 
 
 
346 aa  65.1  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  27.57 
 
 
339 aa  63.9  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  24.14 
 
 
330 aa  63.9  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  22.51 
 
 
357 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 
350 aa  63.5  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1276  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
228 aa  63.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  35.92 
 
 
563 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  24.29 
 
 
332 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  26.56 
 
 
368 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  25.21 
 
 
335 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  24.35 
 
 
350 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  33.02 
 
 
256 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.82 
 
 
335 aa  62.4  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  24.9 
 
 
366 aa  62.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  25.32 
 
 
335 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  26.24 
 
 
219 aa  62  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  29.85 
 
 
359 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  29 
 
 
221 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  29 
 
 
221 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  30.9 
 
 
445 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  34.58 
 
 
573 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  23.94 
 
 
395 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  29 
 
 
221 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  34.95 
 
 
223 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  35.78 
 
 
218 aa  60.1  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  33.61 
 
 
215 aa  60.1  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  25.12 
 
 
214 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>