More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4025 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.82 
 
 		 221 aa  254  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 245 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  57.46 
 
 		 227 aa  251  7e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.71 
 
 		 229 aa  248  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.74 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.74 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.74 
 
 		 231 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.74 
 
 		 231 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 231 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.57 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.37 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.37 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  39.91 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 225 aa  148  8e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 225 aa  148  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  40.27 
 
 		 242 aa  147  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  37.33 
 
 		 242 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  36.89 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  36.89 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  37.95 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11994  diatom response regulator 2  32.75 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45539  diatom response regulator 1  28.1 
 
 		 319 aa  106  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  35.03 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.6 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  34.2 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  34.83 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  34.83 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  34.83 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  43.07 
 
 		 326 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 317 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  37.22 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.07 
 
 		 326 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.78 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4980  DNA-binding response regulator  37.22 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  34.64 
 
 		 414 aa  101  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  34.18 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.67 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  33.9 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  35.39 
 
 		 247 aa  99.8  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  34.16 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 806 aa  99.4  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  32.03 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  34.83 
 
 		 247 aa  99  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1336  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.27 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  34.22 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  31.84 
 
 		 269 aa  98.6  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.8 
 
 		 239 aa  98.6  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  33.15 
 
 		 246 aa  98.2  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  32.96 
 
 		 290 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  38.84 
 
 		 919 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 911 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  38.14 
 
 		 170 aa  97.8  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 240 aa  96.7  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  33.89 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5387  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.16 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3138  two component transcriptional regulator  43.65 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  36.92 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  34.25 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.17 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.84 
 
 		 318 aa  96.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.17 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  42.02 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  39.23 
 
 		 390 aa  96.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  44.44 
 
 		 1172 aa  96.7  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  33.9 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  32.78 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>