33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4007 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4007  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
47 aa  99.8  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  82.61 
 
 
955 aa  81.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  71.74 
 
 
363 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  69.57 
 
 
377 aa  71.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  73.91 
 
 
383 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  67.39 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  68.89 
 
 
358 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  63.04 
 
 
843 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  65.22 
 
 
381 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  60.87 
 
 
366 aa  65.1  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  65.12 
 
 
686 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  62.79 
 
 
357 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  54.35 
 
 
957 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  54.35 
 
 
787 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  58.7 
 
 
751 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  58.7 
 
 
751 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  52.17 
 
 
734 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  56.52 
 
 
695 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  52.17 
 
 
734 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  55.81 
 
 
364 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  54.35 
 
 
882 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  64.52 
 
 
1247 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0298  hypothetical protein  48.89 
 
 
358 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0319  hypothetical protein  48.89 
 
 
358 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  67.74 
 
 
372 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0253  hypothetical protein  48.89 
 
 
358 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  45.65 
 
 
1077 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  47.83 
 
 
1082 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0273  hypothetical protein  46.67 
 
 
317 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  46.67 
 
 
358 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0259  hypothetical protein  46.67 
 
 
317 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0304  hypothetical protein  46.67 
 
 
358 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1198  WbwX  54.84 
 
 
361 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.696944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>