223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3994 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
266 aa  531  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.75 
 
 
391 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  33.96 
 
 
358 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.86 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.37 
 
 
323 aa  82  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.46 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.66 
 
 
319 aa  79  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.91 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  33.51 
 
 
450 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.84 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.42 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.18 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.19 
 
 
575 aa  72.8  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  35.1 
 
 
454 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.48 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0056  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.63 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.1 
 
 
508 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1832  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.19 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  28.9 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.33 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.16 
 
 
160 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.87 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.01 
 
 
334 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  28.57 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.84 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.3 
 
 
487 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  31.58 
 
 
378 aa  65.5  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  37.21 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1518  hypothetical protein  32.93 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.15 
 
 
77 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.31 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  50.77 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.31 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.31 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  28.24 
 
 
395 aa  63.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  28.85 
 
 
396 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  32.09 
 
 
409 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  33.11 
 
 
352 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  46.03 
 
 
228 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  30.88 
 
 
383 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0344  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.93 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  30.72 
 
 
462 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.28 
 
 
321 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  29.08 
 
 
438 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.73 
 
 
356 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  48.44 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.7 
 
 
395 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5099  cell wall hydrolase/autolysin  30.49 
 
 
387 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.58 
 
 
305 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.57 
 
 
395 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4581  cell wall hydrolase/autolysin  29.88 
 
 
392 aa  60.1  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170729 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  44.29 
 
 
243 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  43.55 
 
 
239 aa  59.3  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.25 
 
 
317 aa  58.9  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  35 
 
 
762 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  29.56 
 
 
381 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  42.42 
 
 
423 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.88 
 
 
382 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.27 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.62 
 
 
792 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.89 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.09 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.15 
 
 
128 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.19 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  41.46 
 
 
204 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  42.25 
 
 
236 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.47 
 
 
356 aa  56.6  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.19 
 
 
422 aa  56.2  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1842  hypothetical protein  40.85 
 
 
306 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.224283  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.15 
 
 
163 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4755  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.77 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15503  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.95 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.26 
 
 
323 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  40.68 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3583  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.44 
 
 
344 aa  54.3  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  32 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  44.26 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  44.83 
 
 
396 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  38.75 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.67 
 
 
554 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1408  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.4 
 
 
478 aa  53.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.44 
 
 
266 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26920  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  41.94 
 
 
254 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  40.98 
 
 
224 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1011  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.79 
 
 
317 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404081  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  28 
 
 
313 aa  52.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9263  hypothetical protein  34.34 
 
 
381 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.553952 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.65 
 
 
635 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  26.88 
 
 
379 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  41.1 
 
 
229 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.42 
 
 
1089 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  43.94 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5152  peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.67 
 
 
358 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1435  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.93 
 
 
363 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18110  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  39.06 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.459182  normal  0.956828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>