18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3933 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3933  hypothetical protein  100 
 
 
479 aa  985    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.218593  unclonable  0.0000403133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3924  hypothetical protein  62.13 
 
 
438 aa  590  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647872  hitchhiker  0.00979003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1557  hypothetical protein  50.96 
 
 
450 aa  468  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.283773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2105  hypothetical protein  50.53 
 
 
434 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843241  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3770  hypothetical protein  50 
 
 
455 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00806133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2892  hypothetical protein  47.67 
 
 
443 aa  428  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000583528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1840  hypothetical protein  47.75 
 
 
443 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835777  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1810  hypothetical protein  31.49 
 
 
441 aa  222  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0697  hypothetical protein  29.87 
 
 
468 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3997  hypothetical protein  30.6 
 
 
441 aa  207  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.200317  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4870  hypothetical protein  27.39 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1452  hypothetical protein  26.37 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150182  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2243  hypothetical protein  42.86 
 
 
145 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1894  hypothetical protein  25.39 
 
 
440 aa  110  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.999283  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0872  hypothetical protein  21.44 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0833922  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0417  AAA ATPase  22.53 
 
 
433 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2007  hypothetical protein  20.53 
 
 
455 aa  60.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2653  hypothetical protein  41.89 
 
 
75 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>