More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3887 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 117 aa  236  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  68.37 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  66.67 
 
 		 107 aa  133  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  67.03 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  61.46 
 
 		 106 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  62.37 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  61.29 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  58.76 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  59.14 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  58.06 
 
 		 174 aa  110  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  55.67 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  58.06 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  52.88 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  53.61 
 
 		 172 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  55.91 
 
 		 138 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  57.3 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  56.04 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  54.95 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  42.22 
 
 		 95 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  40.66 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  42.7 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  35.58 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  34.62 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  35.92 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  34.62 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  34.62 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  34.62 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  34.31 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  30.85 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  38.1 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  29.46 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  30.68 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  29.21 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0399  30S ribosomal protein S6  37.78 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>