62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3874 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3874  HAD family hydrolase  100 
 
 
260 aa  535  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0597322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3590  HAD family hydrolase  56 
 
 
270 aa  306  2e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.684772  normal  0.0477257 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0088  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  55.25 
 
 
265 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5151  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  50.2 
 
 
321 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0566  HAD family hydrolase  42.23 
 
 
251 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0688357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0610  HAD family hydrolase  34.22 
 
 
282 aa  127  2e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52168e-06 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1184  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.92 
 
 
297 aa  115  7e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24726  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1091  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.16 
 
 
297 aa  114  2e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.024164  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2053  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
287 aa  111  1e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2700  HAD family hydrolase  26.8 
 
 
270 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4133  HAD family hydrolase  31 
 
 
271 aa  108  7e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2056  HAD family hydrolase  26.94 
 
 
268 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413042  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2097  HAD family hydrolase  29.46 
 
 
268 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.978592  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5196  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.25 
 
 
278 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3500  HAD family hydrolase  27.34 
 
 
267 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1263  hypothetical protein  29.02 
 
 
295 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151023  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0769  HAD family hydrolase  26.64 
 
 
257 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0183682  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4690  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.98 
 
 
275 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2219  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
259 aa  99  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5932  HAD family hydrolase  29.32 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0616  HAD family hydrolase  29.32 
 
 
278 aa  96.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0595  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.92 
 
 
278 aa  95.9  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5210  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.71 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.43756 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6271  HAD family hydrolase  25.7 
 
 
263 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.690052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1558  HAD family hydrolase  25.7 
 
 
263 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6760  HAD family hydrolase  25.7 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06400  hypothetical protein  29.26 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0644  HAD family hydrolase  28.97 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4067  HAD family hydrolase  27.86 
 
 
301 aa  89.4  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0884  SPP-like hydrolase  26.78 
 
 
222 aa  69.3  6e-11  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  25.46 
 
 
265 aa  60.8  2e-08  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1166  SPP-like hydrolase  26.23 
 
 
240 aa  61.2  2e-08  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1223  SPP-like hydrolase  26.27 
 
 
240 aa  55.5  9e-07  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0131794  normal  0.788944 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0788  SPP-like hydrolase  26.42 
 
 
228 aa  52.8  5e-06  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00672208 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1070  SPP-like hydrolase  25.1 
 
 
228 aa  51.6  1e-05  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0195406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2337  phosphoglycolate phosphatase  26.83 
 
 
226 aa  50.4  2e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.488898  normal  0.0135027 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2130  SPP-like hydrolase  24.87 
 
 
222 aa  51.2  2e-05  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  1.13582e-09  hitchhiker  5.79549e-05 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  23.99 
 
 
265 aa  51.2  2e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  23.22 
 
 
272 aa  50.1  3e-05  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1580  Cof-like hydrolase  22.88 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  22.37 
 
 
554 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  24.9 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  22.37 
 
 
554 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 
285 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0866  SPP-like hydrolase  25.82 
 
 
228 aa  45.8  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  23.39 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  23.01 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8838  hypothetical protein  24.07 
 
 
572 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1945  HAD family hydrolase  25.87 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl481  HAD-superfamily cof-like hydrolase  22.9 
 
 
282 aa  44.7  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0685  SPP-like hydrolase  23.21 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  30.23 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2034  phosphoglycolate phosphatase  24.41 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.376803  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30 
 
 
282 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0730  SPP-like hydrolase  23.86 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.842566  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1965  SPP-like hydrolase  22.89 
 
 
230 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0481119  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  31.08 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  22.94 
 
 
271 aa  42.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  21.95 
 
 
271 aa  42  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  22.58 
 
 
271 aa  42  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0700  putative HAD superfamily hydrolase  21.99 
 
 
273 aa  42  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  21.95 
 
 
271 aa  42  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>