More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3820 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3820  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
1453 aa  2979    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0106  AMP-dependent synthetase and ligase  40.69 
 
 
512 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2230  coenzyme A synthetase-like protein  39.02 
 
 
535 aa  320  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2463  AMP-dependent synthetase and ligase  40.18 
 
 
506 aa  315  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0212  AMP-dependent synthetase and ligase  41.6 
 
 
511 aa  311  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  33.4 
 
 
3824 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1561  AMP-forming acyl-CoA synthetase/ligase  41.42 
 
 
511 aa  309  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  33.4 
 
 
2664 aa  310  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1217  AMP-dependent synthetase and ligase  39.18 
 
 
513 aa  310  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.335283  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2140  AMP-dependent synthetase and ligase  39.53 
 
 
526 aa  305  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109279  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2417  AMP-dependent synthetase and ligase  39.35 
 
 
526 aa  302  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.154607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2100  AMP-dependent synthetase and ligase  39.24 
 
 
526 aa  302  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.467333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2527  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 
504 aa  296  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3041  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 
511 aa  294  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43214  predicted protein  29.4 
 
 
1657 aa  294  9e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48666  predicted protein  34.35 
 
 
1643 aa  286  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0961271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  30.78 
 
 
3498 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.66 
 
 
3308 aa  278  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  33.4 
 
 
2581 aa  278  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  31.33 
 
 
2395 aa  277  9e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  31.33 
 
 
2395 aa  277  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  29.79 
 
 
1436 aa  275  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0049  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 
510 aa  273  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.541922  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3738  FkbH like protein  32.13 
 
 
1231 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0423979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3684  FkbH like protein  31.73 
 
 
1231 aa  271  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  32.54 
 
 
1578 aa  266  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  31.7 
 
 
3086 aa  263  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  31.7 
 
 
3086 aa  263  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  32.3 
 
 
2997 aa  262  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  31.33 
 
 
1870 aa  261  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  31.33 
 
 
1870 aa  261  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48436  predicted protein  30.14 
 
 
1503 aa  260  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4343  AMP-dependent synthetase and ligase  36.16 
 
 
506 aa  257  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00101697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0697  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 
506 aa  255  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000262874  decreased coverage  0.0000717801 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37273  predicted protein  34.38 
 
 
674 aa  255  5.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757567  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  33.71 
 
 
3639 aa  253  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  29.02 
 
 
2752 aa  253  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  32.36 
 
 
2033 aa  250  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  30.87 
 
 
1142 aa  248  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  32.28 
 
 
2193 aa  247  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  30.36 
 
 
2164 aa  247  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1793  amino acid adenylation  30.57 
 
 
1370 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0250793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4801  hypothetical protein  34.72 
 
 
2167 aa  246  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  30.95 
 
 
1556 aa  246  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  31.42 
 
 
2006 aa  244  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  30.74 
 
 
1556 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  29.45 
 
 
6676 aa  243  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  30.08 
 
 
2156 aa  241  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  31.3 
 
 
1369 aa  241  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  31.17 
 
 
4960 aa  239  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  28.57 
 
 
3291 aa  240  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  29.32 
 
 
2156 aa  240  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  28.79 
 
 
2883 aa  239  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  30.43 
 
 
2419 aa  239  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  29.19 
 
 
3942 aa  238  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  30.52 
 
 
4960 aa  235  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  31.24 
 
 
6403 aa  235  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  28.65 
 
 
4483 aa  234  8.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  30.53 
 
 
2054 aa  234  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  29.89 
 
 
2571 aa  233  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.07 
 
 
4968 aa  233  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  29.89 
 
 
2571 aa  233  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  28.63 
 
 
2156 aa  231  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.1 
 
 
4531 aa  231  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  30.21 
 
 
1114 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  29.81 
 
 
9498 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  27.79 
 
 
4336 aa  228  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.16 
 
 
5953 aa  227  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1749  amino acid adenylation domain protein  27.77 
 
 
1199 aa  227  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.82306  normal  0.0351239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  30.82 
 
 
4747 aa  227  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  29.23 
 
 
2012 aa  226  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  30.36 
 
 
6661 aa  226  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  28.86 
 
 
1104 aa  226  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.543215 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  31.88 
 
 
2867 aa  225  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  29.56 
 
 
2189 aa  225  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  27.39 
 
 
4342 aa  224  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  29.84 
 
 
4037 aa  224  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  32.09 
 
 
3432 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  28.67 
 
 
2883 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1699  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 
1433 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4891  amino acid adenylation domain-containing protein  29.22 
 
 
1104 aa  223  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0706407  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  25.73 
 
 
4342 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  29.15 
 
 
2151 aa  222  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  30.6 
 
 
1138 aa  221  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.59 
 
 
1363 aa  221  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  27.06 
 
 
4336 aa  221  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  31.49 
 
 
6889 aa  220  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  29.8 
 
 
1550 aa  220  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  28.76 
 
 
5654 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  29.9 
 
 
1569 aa  219  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  28.23 
 
 
4318 aa  219  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  29.35 
 
 
1833 aa  219  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  29.48 
 
 
2626 aa  218  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  29.91 
 
 
7712 aa  218  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  28.16 
 
 
1816 aa  218  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  28.45 
 
 
2365 aa  218  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  29.17 
 
 
3235 aa  217  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  29.31 
 
 
4502 aa  217  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04397  coenzyme A synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06850)  35.79 
 
 
506 aa  216  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  28.33 
 
 
2155 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>