68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3804 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3804  circadian clock protein KaiB  100 
 
 
104 aa  202  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573058  normal  0.0709765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1017  circadian clock protein KaiB  89.22 
 
 
108 aa  183  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5076  circadian clock protein KaiB  89.22 
 
 
103 aa  182  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0600  circadian clock protein KaiB  86.54 
 
 
106 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4294  circadian clock protein KaiB  89.42 
 
 
104 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4232  circadian clock protein KaiB  89.42 
 
 
104 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0347  circadian clock protein KaiB  96.81 
 
 
105 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.891405  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2125  circadian clock protein KaiB  84.47 
 
 
121 aa  174  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13971  circadian clock protein KaiB  84.31 
 
 
114 aa  173  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.65977 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05431  circadian clock protein KaiB  85 
 
 
119 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15291  circadian clock protein KaiB  85.86 
 
 
105 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15041  circadian clock protein KaiB  85.86 
 
 
108 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.293704  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17701  circadian clock protein KaiB  86.6 
 
 
107 aa  171  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0105532  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1441  circadian clock protein KaiB  84.85 
 
 
105 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0914  circadian clock protein KaiB  86.6 
 
 
107 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0548  circadian clock protein KaiB  84 
 
 
120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.346159  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15441  circadian clock protein KaiB  84.85 
 
 
105 aa  170  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.622562  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1217  circadian clock protein KaiB  86.14 
 
 
102 aa  169  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4149  KaiB domain-containing protein  60.67 
 
 
101 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0589651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3358  KaiB domain-containing protein  63.53 
 
 
101 aa  106  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4340  KaiB domain protein  61.36 
 
 
115 aa  104  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464711  decreased coverage  0.000276339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1662  KaiB domain protein  56.47 
 
 
103 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4009  KaiB domain-containing protein  54.12 
 
 
97 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295517  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3933  KaiB domain protein  55.06 
 
 
92 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3982  KaiB domain protein  55.06 
 
 
92 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00133948  hitchhiker  0.00598629 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2227  KaiB domain-containing protein  56.98 
 
 
93 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.923318  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3005  KaiB domain protein  53.33 
 
 
95 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1883  KaiB domain protein  54.35 
 
 
97 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668658  normal  0.619396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4109  KaiB domain-containing protein  53.26 
 
 
130 aa  100  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.11763  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4477  KaiB domain protein  55.29 
 
 
130 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22265  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2968  KaiB domain-containing protein  56.47 
 
 
113 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.833946  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4590  KaiB domain protein  54.12 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463032  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1485  KaiB domain-containing protein  55.29 
 
 
133 aa  97.8  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.04601  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6553  circadian clock protein  54.12 
 
 
98 aa  96.7  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4357  circadian clock protein kaiB  52.87 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1362  KaiB domain protein  52.94 
 
 
100 aa  92  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00398433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3661  KaiB  52.44 
 
 
254 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.535512  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3312  hypothetical protein  55.42 
 
 
91 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.967746  normal  0.156709 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3983  circadian clock KaiB-like protein  53.01 
 
 
89 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2543  KaiB  54.22 
 
 
96 aa  87.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0008  KaiB domain protein  55.56 
 
 
94 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186232  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0742  KaiB  53.01 
 
 
92 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1661  KaiB domain protein  46.51 
 
 
114 aa  85.5  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.74 
 
 
640 aa  84.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0014  KaiB domain-containing protein  48.78 
 
 
251 aa  84  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1617  KaiB domain-containing protein  42.7 
 
 
98 aa  84  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.155318  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3323  KaiB domain protein  43.37 
 
 
247 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.52199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2778  KaiB domain protein  43.37 
 
 
247 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4108  KaiB domain-containing protein  43.37 
 
 
106 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.125834  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2969  KaiB domain-containing protein  43.62 
 
 
101 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3121  KaiB domain protein  45.68 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.282526  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4589  KaiB domain protein  43.37 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1882  KaiB domain protein  48.28 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.980296  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1486  KaiB domain-containing protein  47.67 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26267  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5028  KaiB domain protein  41.46 
 
 
247 aa  80.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0619  KaiB domain protein  50.59 
 
 
93 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4476  KaiB domain protein  42.86 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.386166  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1544  KaiB domain protein  44.44 
 
 
238 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4339  KaiB domain protein  47.67 
 
 
102 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42541  decreased coverage  0.000274688 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4671  KaiB  43.9 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal  0.131957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3294  KaiB  43.82 
 
 
102 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1363  KaiB domain protein  42.22 
 
 
101 aa  70.5  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041708 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1115  hypothetical protein  45.24 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1119  hypothetical protein  45.24 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4010  KaiB domain-containing protein  39.51 
 
 
99 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443916  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3573  response regulator receiver domain-containing protein  36.71 
 
 
229 aa  50.1  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0691  adaptive-response sensory kinase  35.14 
 
 
387 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0609  histidine kinase  38.57 
 
 
395 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>