More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3777 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 368 aa  755    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  59.84 
 
 		 374 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  60.65 
 
 		 373 aa  456  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  60.92 
 
 		 373 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  56.95 
 
 		 370 aa  438  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  52.96 
 
 		 376 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  47.45 
 
 		 376 aa  368  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  35.97 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  34.59 
 
 		 376 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  36.96 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  35.9 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  34.59 
 
 		 376 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  35.01 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  35.37 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07601  NAD binding site  34.88 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1650  geranylgeranyl reductase  35.28 
 
 		 381 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  34.57 
 
 		 377 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  32.4 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  33.79 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  29.75 
 
 		 378 aa  146  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.32 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  29.33 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  31.9 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  28.78 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  25.52 
 
 		 362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.15 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  27 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  28.02 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  29.09 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 		 392 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  28.9 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.48 
 
 		 424 aa  96.3  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 		 403 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 		 425 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  28.62 
 
 		 375 aa  94  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  25.48 
 
 		 430 aa  92.8  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  26.42 
 
 		 393 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  26.75 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  25.14 
 
 		 401 aa  90.1  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  26.1 
 
 		 390 aa  87.8  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 		 434 aa  87  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 		 423 aa  86.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  28.18 
 
 		 421 aa  86.3  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  28.14 
 
 		 379 aa  86.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  28.26 
 
 		 398 aa  86.3  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  27.72 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  34.66 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  25.98 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  27.09 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  27.52 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  29.58 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  29.26 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.43 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  28.05 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  24.3 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.46 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  26.12 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  24.3 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  24.93 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  25.79 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  24.11 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  25.96 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  26.28 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  26.29 
 
 		 423 aa  79.3  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  27.54 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  24.15 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  27.16 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  24.34 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  24.82 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  26.28 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  24.23 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  25.72 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  23.69 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  27.18 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  23.97 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  26.73 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  26.95 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  26.37 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  26.04 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  25.12 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.77 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  27.36 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>