More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3658 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3658  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  100 
 
 
405 aa  849    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108889  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5047  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  67.77 
 
 
400 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5201  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  67.18 
 
 
403 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86768e-21 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3563  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  65.06 
 
 
406 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2543  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  65.06 
 
 
406 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4840  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  58.97 
 
 
439 aa  511  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00169429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  57.91 
 
 
440 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00024869  unclonable  0.0000000785266 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0978  ferredoxin-NADP oxidoreductase  59.9 
 
 
403 aa  485  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000202848  normal  0.0244193 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0749  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  52.75 
 
 
398 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.14944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1917  ferredoxin--NADP reductase (FNR)  53.59 
 
 
396 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484005  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09411  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  57.74 
 
 
366 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0946789 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11821  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  55.59 
 
 
321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.140856  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11811  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  56.39 
 
 
326 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11131  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  52.6 
 
 
361 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.93922 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11651  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  57.77 
 
 
384 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1086  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  54.1 
 
 
370 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.569863  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0675  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  53.42 
 
 
381 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15081  ferredoxin-NADP oxidoreductase (FNR)  55.25 
 
 
387 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459762  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_23717  predicted protein  46.1 
 
 
340 aa  272  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.239668  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12813  predicted protein  47.18 
 
 
298 aa  269  5e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42018  predicted protein  47.08 
 
 
320 aa  269  7e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.953925  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28333  predicted protein  44.63 
 
 
360 aa  267  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0642636  normal  0.462802 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15777  predicted protein  46.03 
 
 
299 aa  251  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.112856  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1220  benzoyl-CoA oxygenase subunit A  35.86 
 
 
415 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.655891  normal  0.0139439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1323  benzoyl-CoA oxygenase, component A  35.86 
 
 
417 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1538  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  37.59 
 
 
416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6638  benzoyl-CoA oxygenase, component A  35.37 
 
 
393 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1424  benzoyl-CoA oxygenase, component A  35.95 
 
 
413 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2694  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  36.6 
 
 
413 aa  186  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0095  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  36.43 
 
 
428 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0890  benzoyl-CoA oxygenase, component A  34.97 
 
 
414 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.48377 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0072  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  36.08 
 
 
439 aa  176  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3661  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  38.55 
 
 
431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0734  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.38 
 
 
424 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197929  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1630  benzoyl-CoA oxygenase, component A  37.69 
 
 
426 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170592  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2942  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.55 
 
 
427 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.453854  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0222  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  37.31 
 
 
423 aa  159  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  37.07 
 
 
607 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  36.1 
 
 
604 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  35.61 
 
 
604 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  35.65 
 
 
1338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  35.61 
 
 
604 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  34.65 
 
 
1257 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  40.32 
 
 
631 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  40.32 
 
 
623 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.76 
 
 
599 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.97 
 
 
594 aa  103  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.47 
 
 
599 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.22 
 
 
599 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.22 
 
 
599 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.6 
 
 
599 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.22 
 
 
596 aa  101  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  38.71 
 
 
613 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  35.5 
 
 
1341 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  35.65 
 
 
610 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  35.06 
 
 
1357 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3056  FAD-binding domain protein  35.17 
 
 
554 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  35.68 
 
 
599 aa  99.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.03 
 
 
591 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  39.06 
 
 
1409 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.43 
 
 
245 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0107588 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  36.02 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  37.63 
 
 
614 aa  97.1  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3748  sulfite reductase  35.62 
 
 
540 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  31.76 
 
 
608 aa  96.7  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  35.14 
 
 
594 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  33.19 
 
 
659 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  32.76 
 
 
599 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  34.15 
 
 
1384 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.76 
 
 
607 aa  94  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  33.19 
 
 
599 aa  94  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  32.03 
 
 
1405 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3790  FAD-binding domain-containing protein  34.89 
 
 
388 aa  92.8  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5007  sulfite reductase  34.05 
 
 
535 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125173  normal  0.198772 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.02 
 
 
584 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.48 
 
 
599 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  32.48 
 
 
599 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  32.48 
 
 
599 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  32.33 
 
 
599 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  32.33 
 
 
599 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  31.9 
 
 
599 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2866  sulfite reductase  34.91 
 
 
537 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890512  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  32.33 
 
 
599 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  31.6 
 
 
615 aa  91.3  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  31.9 
 
 
599 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  32.48 
 
 
599 aa  90.9  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  31.9 
 
 
599 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  31.9 
 
 
599 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.43 
 
 
598 aa  90.5  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  31.9 
 
 
599 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  35.71 
 
 
1407 aa  90.1  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  32.35 
 
 
1232 aa  90.1  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4491  sulfite reductase  34.05 
 
 
534 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4954  sulfite reductase  34.05 
 
 
534 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  31.03 
 
 
601 aa  89.7  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2298  sulfite reductase  34.05 
 
 
534 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253537  normal  0.965047 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  31.47 
 
 
600 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.9 
 
 
605 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  31.47 
 
 
612 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  32.34 
 
 
1418 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>