94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3570 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  44.31 
 
 
1004 aa  656    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  59.25 
 
 
1742 aa  928    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  58.74 
 
 
1349 aa  934    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  59.18 
 
 
1339 aa  895    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  100 
 
 
783 aa  1599    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  60.7 
 
 
2194 aa  932    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  58.06 
 
 
1345 aa  882    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  44.64 
 
 
798 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  49.07 
 
 
1237 aa  750    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5141  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  43.28 
 
 
951 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224088  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  49.5 
 
 
942 aa  744    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  36.38 
 
 
2216 aa  320  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  31.67 
 
 
1150 aa  205  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  26.75 
 
 
1148 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  28.57 
 
 
725 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  29.4 
 
 
805 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  26.28 
 
 
773 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0457  signal transduction protein  26.49 
 
 
1049 aa  112  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  27.62 
 
 
799 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3214  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.25 
 
 
649 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.614434  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  29.41 
 
 
1216 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.33 
 
 
1086 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  24.54 
 
 
766 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1587  protein of unknown function DUF323  24.68 
 
 
1064 aa  106  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.2 
 
 
762 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.2 
 
 
762 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1642  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.5 
 
 
911 aa  104  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.409211 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.11 
 
 
1044 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4811  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.56 
 
 
1067 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.382069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  26.7 
 
 
1053 aa  101  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1602  signal transduction protein  21.49 
 
 
1002 aa  101  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1465  signal transduction protein  26.25 
 
 
570 aa  101  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0460  hypothetical protein  27.27 
 
 
965 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1047  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.57 
 
 
1183 aa  100  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2192  protein of unknown function DUF323  25.98 
 
 
1049 aa  99.4  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1392  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.53 
 
 
1091 aa  98.6  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1553  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.22 
 
 
1023 aa  95.1  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0972336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0735  protein of unknown function DUF323  24.51 
 
 
1201 aa  94.7  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  26.63 
 
 
1581 aa  94.7  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1299  hypothetical protein  25.06 
 
 
1492 aa  94  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  26.48 
 
 
1186 aa  94  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2449  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.93 
 
 
888 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152058  normal  0.158989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2919  hypothetical protein  28.57 
 
 
1080 aa  91.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3131  GUN4 domain protein  25.12 
 
 
818 aa  91.3  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1565  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.21 
 
 
1041 aa  91.3  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  25 
 
 
997 aa  90.5  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2344  protein of unknown function DUF323  24.48 
 
 
1190 aa  87  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3090  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.8 
 
 
908 aa  87  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.624689  normal  0.76371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4765  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.88 
 
 
887 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  22.08 
 
 
801 aa  85.1  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  24.22 
 
 
923 aa  84  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3126  NTPase (NACHT family)-like protein  23.22 
 
 
1282 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.791023  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5122  signal transduction protein  22.55 
 
 
953 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0364  signal transduction protein  24.11 
 
 
960 aa  78.6  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.36 
 
 
1174 aa  78.2  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2296  NACHT family-like NTPase  21.63 
 
 
1267 aa  77.8  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1562  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.09 
 
 
1044 aa  73.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2186  protein of unknown function DUF323  23.93 
 
 
1007 aa  73.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000553602  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5123  hypothetical protein  20.62 
 
 
949 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5241  putative signal transduction protein with Nacht domain  21.96 
 
 
914 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668655  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5750  putative signal transduction protein with Nacht domain  25.3 
 
 
1330 aa  68.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.22 
 
 
872 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5163  signal transduction protein  22.15 
 
 
969 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.72 
 
 
1475 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  22.36 
 
 
1094 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0709  hypothetical protein  27.52 
 
 
447 aa  64.3  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7397  NTPase (NACHT family)-like protein  21.26 
 
 
1106 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3580  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  30.9 
 
 
778 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.786261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3348  NACHT family-like NTPase  26.23 
 
 
260 aa  61.6  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.670607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0676  signal transduction protein  21.69 
 
 
1073 aa  61.6  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.224513  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.4 
 
 
951 aa  61.6  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1483  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.31 
 
 
636 aa  61.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0460  putative signal transduction protein with Nacht domain  22.31 
 
 
1729 aa  60.8  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832377  normal  0.0598199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0119  signal transduction protein  24.35 
 
 
1075 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.955952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
1033 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3298  NACHT family-like NTPase  25.44 
 
 
625 aa  59.3  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1598  hypothetical protein  22.13 
 
 
644 aa  57.4  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  25.35 
 
 
647 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5124  hypothetical protein  22.83 
 
 
951 aa  54.7  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.43 
 
 
1438 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.72 
 
 
1901 aa  54.7  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.67 
 
 
944 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.42 
 
 
1868 aa  52  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  24.93 
 
 
1766 aa  51.2  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  21.85 
 
 
1807 aa  50.8  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.19 
 
 
1343 aa  48.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3605  NTPase (NACHT family)-like protein  20.27 
 
 
1225 aa  47.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.442586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.65 
 
 
852 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1482  NTPase (NACHT family)-like protein  22.84 
 
 
1051 aa  45.8  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  23.5 
 
 
1818 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8620  putative signal transduction protein with Nacht domain  24.2 
 
 
1239 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00545608  normal  0.590106 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0411  hypothetical protein  24.44 
 
 
637 aa  45.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0440311  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0068  hypothetical protein  25.65 
 
 
1200 aa  44.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1339  hypothetical protein  23.25 
 
 
1060 aa  44.3  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>