90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3559 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3559  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 
254 aa  507  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1454  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.87 
 
 
252 aa  236  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4224  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.5 
 
 
252 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.851728  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0529  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.52 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0546  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase-like protein  29.52 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00871  hypothetical protein  30.05 
 
 
259 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4023  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.85 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0216  hypothetical protein  27.88 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1353  hypothetical protein  30.77 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.562603  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3577  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.19 
 
 
248 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1906  hypothetical protein  31.58 
 
 
246 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32779  normal  0.659216 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20991  hypothetical protein  29.81 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.449797 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2528  hypothetical protein  27.83 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.333422  normal  0.549584 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3835  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.7 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.834498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0474  putative peptidyl-prolyl isomerase  25.5 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139387  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3511  hypothetical protein  25.43 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1223  hypothetical protein  26.19 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.102952  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0412  hypothetical protein  25.73 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4001  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.1 
 
 
250 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1838  hypothetical protein  27.47 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3275  hypothetical protein  24.77 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2846  hypothetical protein  24.77 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0749959 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0024  hypothetical protein  29.5 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0928  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.27 
 
 
250 aa  72  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.496097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2682  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.36 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3421  hypothetical protein  22.36 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.449805  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0223  hypothetical protein  22.36 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000261911  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5022  hypothetical protein  23.31 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1053  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.14 
 
 
416 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0556078  normal  0.850667 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0730  hypothetical protein  20.83 
 
 
261 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1512  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.16 
 
 
355 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00064667  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0911  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.14 
 
 
354 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.159559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4385  hypothetical protein  23.03 
 
 
252 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.016831 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0116  hypothetical protein  29.09 
 
 
246 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0719  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.89 
 
 
350 aa  52  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0989  SurA domain protein  24.59 
 
 
305 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.47061  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0103  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25 
 
 
632 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199337  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0966  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.5 
 
 
359 aa  50.8  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000363046  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1844  hypothetical protein  25.87 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6034  SurA domain-containing protein  23.33 
 
 
475 aa  49.3  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4381  hypothetical protein  18.1 
 
 
260 aa  48.9  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.5 
 
 
432 aa  48.5  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1707  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.87 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1000  hypothetical protein  23.89 
 
 
581 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00918654  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1130  hypothetical protein  23.89 
 
 
581 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1660  hypothetical protein  26.76 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000295507  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0887  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.61 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0142655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0659  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.87 
 
 
324 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3633  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  24 
 
 
431 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4862  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.75 
 
 
473 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.042366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0923  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  31.43 
 
 
330 aa  45.4  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228193  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1081  SurA domain-containing protein  27.97 
 
 
434 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00545123  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0979  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.97 
 
 
434 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3311  SurA domain protein  27.97 
 
 
434 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000542375  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1048  SurA domain-containing protein  27.97 
 
 
434 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000188646  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3637  survival protein surA  27.97 
 
 
434 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3207  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.97 
 
 
434 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00341514  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3113  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.97 
 
 
434 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.980889  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3509  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.95 
 
 
447 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0015  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.73 
 
 
329 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1262  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.63 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0015  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.73 
 
 
329 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2760  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.19 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1314  hypothetical protein  28.57 
 
 
93 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2863  survival protein SurA  30.23 
 
 
431 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00164728  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0907  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.97 
 
 
434 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00235031  normal  0.382454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1168  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.16 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0639  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.01 
 
 
335 aa  42.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.143163  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00056  hypothetical protein  23.95 
 
 
428 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0286102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3830  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.5 
 
 
431 aa  42.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.95 
 
 
428 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000704292  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase)  23.95 
 
 
428 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3546  SurA domain protein  23.95 
 
 
428 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00416172  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0253  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  21.27 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3442  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.61 
 
 
434 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000041378  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.95 
 
 
428 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000468252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0059  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.95 
 
 
428 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0538241  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1441  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.72 
 
 
558 aa  42.7  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0770  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.61 
 
 
434 aa  42.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524485  normal  0.0902851 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3571  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  22.61 
 
 
434 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.95 
 
 
428 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202628  hitchhiker  0.000135274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0057  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.95 
 
 
428 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283729  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0047  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.95 
 
 
428 aa  43.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000013551  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00810  hypothetical protein  30.77 
 
 
427 aa  42.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  23.38 
 
 
430 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2830  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.16 
 
 
284 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0809  peptidylprolyl isomerase  24.31 
 
 
282 aa  42.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0126542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4226  peptidylprolyl isomerase  26.92 
 
 
289 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0107977  hitchhiker  0.00167093 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0106  foldase protein PrsA  25 
 
 
299 aa  42  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.49 
 
 
442 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>