More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3459 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 3193 aa  6474    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  38.35 
 
 		 2003 aa  621  1e-176  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  35.57 
 
 		 2632 aa  540  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  70.79 
 
 		 940 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  69.65 
 
 		 690 aa  443  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  59.44 
 
 		 912 aa  444  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.26 
 
 		 1372 aa  438  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  62.19 
 
 		 3041 aa  437  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.7 
 
 		 1154 aa  343  2.9999999999999998e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1636  peptidase  29.69 
 
 		 800 aa  287  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  28.62 
 
 		 2294 aa  269  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  29.77 
 
 		 2096 aa  255  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  30.99 
 
 		 1271 aa  253  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.87 
 
 		 1352 aa  250  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  29.61 
 
 		 1600 aa  222  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.79 
 
 		 1917 aa  222  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  28.74 
 
 		 1942 aa  221  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  25.7 
 
 		 2035 aa  216  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  26.41 
 
 		 1669 aa  216  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  28.55 
 
 		 1840 aa  212  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  28.25 
 
 		 1959 aa  206  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1611 aa  204  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.85 
 
 		 1614 aa  204  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.39 
 
 		 1586 aa  202  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.43 
 
 		 1595 aa  202  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  28.55 
 
 		 1576 aa  199  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  27.42 
 
 		 1572 aa  197  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  28.19 
 
 		 1485 aa  197  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  27.85 
 
 		 2277 aa  197  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  27.53 
 
 		 1517 aa  189  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  29.66 
 
 		 3027 aa  189  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1527 aa  186  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.94 
 
 		 2149 aa  186  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26.63 
 
 		 1485 aa  186  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.89 
 
 		 1551 aa  182  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.99 
 
 		 1520 aa  181  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  27.11 
 
 		 1599 aa  179  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.62 
 
 		 2731 aa  176  9e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  27.2 
 
 		 1495 aa  175  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.37 
 
 		 1197 aa  174  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  25.15 
 
 		 1156 aa  174  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.83 
 
 		 1381 aa  173  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  36.3 
 
 		 470 aa  172  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  27.69 
 
 		 1467 aa  172  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  26.05 
 
 		 1531 aa  172  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1400 aa  172  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  26.09 
 
 		 1518 aa  172  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.17 
 
 		 1384 aa  171  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  26.42 
 
 		 1259 aa  171  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.49 
 
 		 1560 aa  170  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  26.37 
 
 		 1008 aa  170  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  26.37 
 
 		 1008 aa  170  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  27.16 
 
 		 1487 aa  170  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1554 aa  169  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  25.64 
 
 		 927 aa  169  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  27.94 
 
 		 840 aa  169  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  27.01 
 
 		 1433 aa  169  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.23 
 
 		 1489 aa  167  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1547 aa  167  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  27.09 
 
 		 1475 aa  167  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1409 aa  166  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1494 aa  166  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  25.82 
 
 		 1494 aa  166  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  28.99 
 
 		 741 aa  164  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  26.59 
 
 		 1457 aa  164  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  26.93 
 
 		 1385 aa  163  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.49 
 
 		 924 aa  163  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  27.18 
 
 		 1437 aa  163  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  27.62 
 
 		 867 aa  163  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  27.09 
 
 		 1411 aa  163  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  26.33 
 
 		 1345 aa  163  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  23.88 
 
 		 1594 aa  163  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  26.33 
 
 		 1345 aa  163  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1386 aa  162  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  25.5 
 
 		 1639 aa  161  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  27.65 
 
 		 903 aa  160  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  27.89 
 
 		 690 aa  160  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  27.9 
 
 		 1417 aa  159  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  27.32 
 
 		 1362 aa  159  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  25.31 
 
 		 1379 aa  159  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.4 
 
 		 1568 aa  158  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  23.85 
 
 		 1609 aa  159  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  28.5 
 
 		 788 aa  158  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  28.5 
 
 		 788 aa  158  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  26.87 
 
 		 1422 aa  158  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  24.33 
 
 		 1429 aa  157  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  25.65 
 
 		 1415 aa  157  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  24.37 
 
 		 1488 aa  157  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  26.65 
 
 		 931 aa  157  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  25.71 
 
 		 1509 aa  156  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  53.38 
 
 		 922 aa  156  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24.04 
 
 		 1541 aa  155  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  50.68 
 
 		 938 aa  156  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  24.04 
 
 		 1541 aa  155  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.93 
 
 		 1550 aa  155  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  24.84 
 
 		 1981 aa  155  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  25.25 
 
 		 1419 aa  154  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  28.55 
 
 		 764 aa  155  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.66 
 
 		 1527 aa  154  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  23.89 
 
 		 1541 aa  154  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>