More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3375 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3375  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  276  9e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  62.04 
 
 
137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  59.56 
 
 
135 aa  172  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4276  UspA domain-containing protein  58.82 
 
 
135 aa  169  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0090  UspA domain protein  59.12 
 
 
137 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  58.39 
 
 
137 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0959  UspA domain protein  50.74 
 
 
131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  0.295172 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1115  hypothetical protein  50.74 
 
 
126 aa  140  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.198517  normal  0.698975 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27981  universal stress protein  46.32 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  31.62 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  27.86 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  31.69 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  29.32 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  30.5 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  29.17 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  25.93 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  29.08 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  30.28 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  31.91 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  30.07 
 
 
143 aa  55.1  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  31.4 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  28.97 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.66 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.17 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  26.92 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  27.4 
 
 
305 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  24.84 
 
 
180 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  26.09 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  27.44 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 
166 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  28.87 
 
 
141 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 
142 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 
145 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  27.59 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
138 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 
166 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0473  hypothetical protein  35.92 
 
 
282 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.203309  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  31.47 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  26.9 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  30.61 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  36.59 
 
 
177 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  26.95 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  29.5 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  26.83 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  30.99 
 
 
207 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  44.44 
 
 
297 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  27.66 
 
 
286 aa  50.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  25.95 
 
 
182 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  25.95 
 
 
182 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  28.47 
 
 
141 aa  50.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  26.24 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  26.24 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  23.33 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  28.28 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  24.64 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  27.27 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  26.06 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  27.63 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  26.09 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  25.48 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1529  hypothetical protein  32.84 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  31.88 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  25.35 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  27.94 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
138 aa  48.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.67 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4503  hypothetical protein  31.91 
 
 
280 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0340  UspA domain protein  26.42 
 
 
160 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3732  UspA domain protein  32.14 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.212348  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  32.31 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  24.82 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  31.9 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  28.08 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  24.56 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  25.53 
 
 
300 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 
290 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  29.79 
 
 
150 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  27.78 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  29.45 
 
 
294 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>