More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3222 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  100 
 
 
378 aa  777    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  61.39 
 
 
366 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  60.06 
 
 
360 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  60.06 
 
 
360 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  56.77 
 
 
390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  54.04 
 
 
368 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  46.93 
 
 
355 aa  312  4.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  46.78 
 
 
369 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  45.27 
 
 
346 aa  294  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17671  ABC transporter ATP-binding protein  46.04 
 
 
352 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  42.02 
 
 
387 aa  291  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  45.28 
 
 
369 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  44.57 
 
 
342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  45.03 
 
 
369 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08431  ABC transporter ATP-binding protein  43.75 
 
 
352 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  45.03 
 
 
369 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  49.55 
 
 
352 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  43.85 
 
 
360 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.21 
 
 
377 aa  286  4e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  44.48 
 
 
369 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0211  ATPase  42.9 
 
 
352 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  44.26 
 
 
378 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  45.4 
 
 
389 aa  281  1e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  46.45 
 
 
357 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  43.32 
 
 
369 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  44.08 
 
 
343 aa  276  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  46.13 
 
 
353 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  45.27 
 
 
342 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  42.7 
 
 
355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  40.37 
 
 
386 aa  272  6e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  41.71 
 
 
359 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  42.26 
 
 
357 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  44.51 
 
 
363 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  40.7 
 
 
352 aa  271  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  42.9 
 
 
343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  43.02 
 
 
358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  43.37 
 
 
354 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  42.03 
 
 
356 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  43.24 
 
 
379 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  45.13 
 
 
368 aa  266  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  45.88 
 
 
374 aa  266  5e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07781  ABC transporter ATP-binding protein  39.34 
 
 
352 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  40.11 
 
 
343 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  43.2 
 
 
349 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  42.6 
 
 
349 aa  264  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 
343 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  41.5 
 
 
353 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  42.51 
 
 
342 aa  263  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  41.37 
 
 
369 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 
346 aa  263  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  43.2 
 
 
349 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  41.11 
 
 
365 aa  262  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  41.52 
 
 
349 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 
353 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.23 
 
 
349 aa  261  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  42.9 
 
 
349 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  42.73 
 
 
352 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 
353 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  41.5 
 
 
361 aa  260  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  41.84 
 
 
355 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  42.46 
 
 
347 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  41.81 
 
 
349 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  39.78 
 
 
361 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  42.51 
 
 
363 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  42.9 
 
 
349 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  40.77 
 
 
358 aa  260  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08641  ABC transporter ATP-binding protein  39.3 
 
 
352 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  40.77 
 
 
358 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  42.98 
 
 
355 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  39.84 
 
 
363 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.69 
 
 
341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.14 
 
 
353 aa  259  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  41.52 
 
 
349 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09571  ABC transporter ATP-binding protein  40.12 
 
 
356 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0852854  hitchhiker  0.000225107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  39.02 
 
 
363 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  42.08 
 
 
356 aa  256  6e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08671  ABC transporter ATP-binding protein  40.22 
 
 
352 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  42.55 
 
 
362 aa  255  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  42.66 
 
 
333 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  49.6 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.28 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  46.89 
 
 
350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  40.39 
 
 
343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.21 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  57.85 
 
 
257 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  49.6 
 
 
353 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  39.78 
 
 
410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.81 
 
 
370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.82 
 
 
362 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  45.48 
 
 
352 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  40.67 
 
 
376 aa  252  7e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.63 
 
 
352 aa  252  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  42.7 
 
 
353 aa  252  8.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  45.48 
 
 
352 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  51.63 
 
 
384 aa  251  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  40.93 
 
 
375 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  52.78 
 
 
257 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  57.4 
 
 
257 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  55.02 
 
 
352 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  37.57 
 
 
367 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>