More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3218 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 371 aa  755    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  65.12 
 
 		 325 aa  428  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  70 
 
 		 317 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  72.57 
 
 		 319 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  68.67 
 
 		 326 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  63.19 
 
 		 344 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  50.32 
 
 		 313 aa  310  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0773  periplasmic solute binding protein  45.2 
 
 		 335 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0800  periplasmic solute binding protein  45.51 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.043708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  41.91 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  45.2 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  40.37 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0288  periplasmic solute binding protein  38.49 
 
 		 326 aa  219  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  35.37 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  35.37 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  36.12 
 
 		 293 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  33.58 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  35.56 
 
 		 298 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  34.41 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  34.41 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  34.41 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  37.46 
 
 		 309 aa  189  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.19 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3728  periplasmic solute binding protein  39.58 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  35.37 
 
 		 309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  33.44 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3624  periplasmic solute binding protein  39.22 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  32.6 
 
 		 301 aa  183  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  34.07 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  31.31 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  36.4 
 
 		 346 aa  179  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  36.42 
 
 		 315 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  31.37 
 
 		 309 aa  176  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  34.05 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  31.05 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  34.1 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  31.85 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  32.89 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  31.94 
 
 		 341 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  32.45 
 
 		 315 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  31.6 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  33.84 
 
 		 328 aa  168  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  32.01 
 
 		 294 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  30.39 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  32.01 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  33.93 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  34.98 
 
 		 310 aa  166  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  33.33 
 
 		 312 aa  166  9e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  31.02 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  29.18 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.75 
 
 		 313 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  33.56 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  30.8 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  33.98 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  31.18 
 
 		 298 aa  163  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  29.59 
 
 		 292 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  36.2 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 		 303 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  31.94 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  32.39 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  28.75 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  32.38 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  32.65 
 
 		 321 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  29.41 
 
 		 304 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  35.09 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  28.91 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  31.4 
 
 		 321 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  34.2 
 
 		 323 aa  157  4e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 301 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  31.8 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  31.02 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  31.17 
 
 		 306 aa  156  6e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0669  periplasmic solute binding protein  32.18 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0654  periplasmic solute binding protein  32.18 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00869057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  30.35 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2133  periplasmic solute binding protein  35.14 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  30.57 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  27.07 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.8 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  30.47 
 
 		 305 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  31.46 
 
 		 302 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0701  periplasmic solute binding protein  32.26 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000705514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  28.23 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  32.25 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  30.32 
 
 		 335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  29.21 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  31.54 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.21 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2149  periplasmic solute binding protein  29.84 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.21 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.21 
 
 		 305 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0290  ABC transporter, substrate-binding protein  30.33 
 
 		 309 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.74 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  30.1 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  32.74 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  33.1 
 
 		 294 aa  146  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>