More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3216 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  100 
 
 		 595 aa  1096    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  53.07 
 
 		 1363 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  45.82 
 
 		 1279 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  47.2 
 
 		 946 aa  289  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  41.24 
 
 		 613 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.05 
 
 		 1795 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  40.96 
 
 		 1534 aa  227  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  39.72 
 
 		 1400 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  41.03 
 
 		 2954 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  40.58 
 
 		 1532 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  38.72 
 
 		 3954 aa  212  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  38.24 
 
 		 965 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  41.51 
 
 		 4334 aa  209  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  42.07 
 
 		 2105 aa  198  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  40.51 
 
 		 526 aa  196  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  35.73 
 
 		 824 aa  190  8e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  35.05 
 
 		 4800 aa  187  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  39.23 
 
 		 9867 aa  184  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  35.91 
 
 		 2689 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  43.2 
 
 		 1424 aa  183  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.17 
 
 		 2678 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.21 
 
 		 3427 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  34.78 
 
 		 1156 aa  179  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.71 
 
 		 980 aa  178  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  37.72 
 
 		 1499 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  36.03 
 
 		 556 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  36.82 
 
 		 1855 aa  176  7e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  36.46 
 
 		 1079 aa  176  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  41.81 
 
 		 1164 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  41.64 
 
 		 393 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  34.77 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  42.12 
 
 		 833 aa  167  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  40.95 
 
 		 2145 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  45.06 
 
 		 1287 aa  164  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  32.37 
 
 		 1895 aa  161  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  35 
 
 		 2911 aa  160  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  37.24 
 
 		 1544 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  33.79 
 
 		 795 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  43.33 
 
 		 2667 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  38.11 
 
 		 437 aa  157  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  43.73 
 
 		 491 aa  157  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  41.98 
 
 		 341 aa  157  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  41.48 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  37.8 
 
 		 437 aa  153  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0803  hypothetical protein  39.72 
 
 		 634 aa  153  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.165447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  42.43 
 
 		 363 aa  153  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  38.04 
 
 		 2775 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  35.77 
 
 		 860 aa  151  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.03 
 
 		 2668 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  38.42 
 
 		 3619 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  39.2 
 
 		 3619 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  35.17 
 
 		 1884 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  44.18 
 
 		 460 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  39.68 
 
 		 396 aa  148  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  40.84 
 
 		 341 aa  147  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  39.88 
 
 		 4687 aa  143  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  42.04 
 
 		 615 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  33.57 
 
 		 769 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  35.23 
 
 		 589 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  37.95 
 
 		 3608 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  32.41 
 
 		 3209 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  35.81 
 
 		 950 aa  139  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  35.79 
 
 		 1383 aa  138  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  35.33 
 
 		 518 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  34.38 
 
 		 14829 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  47.92 
 
 		 589 aa  136  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  33.5 
 
 		 959 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  45.12 
 
 		 982 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  41.86 
 
 		 460 aa  133  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  35.06 
 
 		 1197 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  29.06 
 
 		 682 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.37 
 
 		 1963 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  39.86 
 
 		 850 aa  131  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  33.66 
 
 		 15831 aa  130  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.07 
 
 		 588 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0017  hemolysin-type calcium-binding region  36.09 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  42.21 
 
 		 357 aa  127  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  33.87 
 
 		 4723 aa  127  7e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  36.09 
 
 		 516 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  36.83 
 
 		 1043 aa  126  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  35.45 
 
 		 820 aa  126  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  37.39 
 
 		 728 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  40.24 
 
 		 639 aa  123  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  32.55 
 
 		 1480 aa  123  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  45.6 
 
 		 243 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  39.11 
 
 		 724 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.39 
 
 		 1236 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  50.96 
 
 		 280 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  50.96 
 
 		 280 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  32.29 
 
 		 1112 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  43.02 
 
 		 561 aa  120  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  40.42 
 
 		 424 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  42.72 
 
 		 260 aa  120  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  35.57 
 
 		 3026 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  34.54 
 
 		 2836 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  33.61 
 
 		 855 aa  120  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  30.6 
 
 		 2467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  44.81 
 
 		 232 aa  117  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  33.61 
 
 		 623 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.74 
 
 		 833 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>