More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3188 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  39.62 
 
 
827 aa  667    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  38.68 
 
 
835 aa  644    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  40.98 
 
 
832 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  39.16 
 
 
836 aa  646    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  73.29 
 
 
842 aa  1300    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  51.26 
 
 
837 aa  894    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  72.36 
 
 
841 aa  1284    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  39.16 
 
 
835 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  67.67 
 
 
842 aa  1200    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  41.18 
 
 
830 aa  654    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  39.28 
 
 
836 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  100 
 
 
843 aa  1739    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  73.89 
 
 
842 aa  1307    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  40.98 
 
 
832 aa  646    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  73.16 
 
 
840 aa  1298    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  42.52 
 
 
816 aa  686    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  38.76 
 
 
836 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  37.92 
 
 
835 aa  629  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  40.6 
 
 
835 aa  632  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  39.02 
 
 
820 aa  632  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  38.64 
 
 
836 aa  628  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  39.86 
 
 
828 aa  625  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  40.22 
 
 
818 aa  616  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  37.71 
 
 
841 aa  618  1e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  40.02 
 
 
830 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  37.06 
 
 
832 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  37.38 
 
 
833 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  37.53 
 
 
828 aa  604  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  37.59 
 
 
827 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  36.69 
 
 
843 aa  597  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  37.85 
 
 
810 aa  595  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  36.7 
 
 
834 aa  591  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.79 
 
 
828 aa  586  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.28 
 
 
842 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  37.1 
 
 
818 aa  571  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  37.73 
 
 
820 aa  567  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  37.13 
 
 
833 aa  550  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  36.2 
 
 
821 aa  533  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  33.94 
 
 
854 aa  504  1e-141  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  33.97 
 
 
828 aa  500  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  33.61 
 
 
776 aa  465  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  37.52 
 
 
712 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.46 
 
 
784 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  29.31 
 
 
785 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  28.04 
 
 
784 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  27.34 
 
 
784 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  28.04 
 
 
784 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  27.34 
 
 
784 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.59 
 
 
784 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  27.34 
 
 
784 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  28.29 
 
 
784 aa  398  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  28.41 
 
 
784 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  28.29 
 
 
784 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  38.21 
 
 
370 aa  296  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  38.48 
 
 
370 aa  295  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  39.02 
 
 
370 aa  291  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  40.06 
 
 
347 aa  268  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  39.12 
 
 
346 aa  266  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  39.75 
 
 
347 aa  266  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  39.83 
 
 
343 aa  263  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  37.27 
 
 
392 aa  253  9.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  41.3 
 
 
329 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  34.93 
 
 
399 aa  248  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  36.96 
 
 
361 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  34.72 
 
 
361 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  37.84 
 
 
349 aa  241  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  33.6 
 
 
366 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  34.55 
 
 
392 aa  239  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  36.03 
 
 
381 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  36.65 
 
 
361 aa  238  4e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.31 
 
 
389 aa  235  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  36.22 
 
 
348 aa  231  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  34.99 
 
 
387 aa  231  6e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  35.1 
 
 
388 aa  230  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  34.06 
 
 
367 aa  228  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  34.41 
 
 
388 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  34.41 
 
 
388 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
389 aa  225  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 
387 aa  225  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  34.12 
 
 
387 aa  223  9e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 
388 aa  223  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.24 
 
 
392 aa  222  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.24 
 
 
392 aa  222  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0300  nucleotidyl transferase  34.58 
 
 
397 aa  221  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  34.07 
 
 
389 aa  218  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.96 
 
 
392 aa  218  4e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.24 
 
 
392 aa  216  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  32.12 
 
 
392 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.64 
 
 
392 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.63 
 
 
392 aa  216  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0327  putative nucleotidyl transferase  35.4 
 
 
381 aa  214  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.54 
 
 
392 aa  214  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.04 
 
 
392 aa  214  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  32.97 
 
 
392 aa  214  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  34.6 
 
 
370 aa  212  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  33.97 
 
 
359 aa  211  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.73 
 
 
392 aa  211  4e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  35.7 
 
 
362 aa  205  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0712  nucleotidyl transferase  33.9 
 
 
376 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  31.06 
 
 
363 aa  200  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>