More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3155 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  61.34 
 
 
1156 aa  1375    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  57.98 
 
 
1180 aa  1308    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
1172 aa  2407    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  36.83 
 
 
1299 aa  328  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  38.89 
 
 
1427 aa  320  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 
1426 aa  314  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  45.16 
 
 
584 aa  313  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  45.33 
 
 
584 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 
1431 aa  312  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 
1048 aa  311  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
1153 aa  309  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 
1646 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.46 
 
 
1514 aa  300  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.46 
 
 
1514 aa  300  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
1010 aa  300  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  37.53 
 
 
1202 aa  300  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
1131 aa  300  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.87 
 
 
1651 aa  298  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 
1415 aa  298  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.84 
 
 
1152 aa  296  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
1385 aa  293  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
1013 aa  291  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 
1390 aa  291  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 
1390 aa  291  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 
1390 aa  291  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
1140 aa  290  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
1002 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
1383 aa  288  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 
1406 aa  288  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
1711 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
1118 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
1559 aa  282  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
1003 aa  281  7e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  29.88 
 
 
1207 aa  280  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
1370 aa  279  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
1361 aa  278  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 
1248 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  35.97 
 
 
919 aa  273  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 
1631 aa  271  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  31.44 
 
 
1133 aa  269  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  46.08 
 
 
557 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 
1119 aa  266  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 
1645 aa  265  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1287 aa  265  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  34.87 
 
 
1347 aa  261  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.01 
 
 
1051 aa  260  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  35.57 
 
 
1366 aa  258  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
1383 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  44.48 
 
 
557 aa  253  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
1274 aa  251  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4817  response regulator receiver modulated serine phosphatase with GAF sensor  44.1 
 
 
553 aa  249  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  29.48 
 
 
1130 aa  247  9e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  33.6 
 
 
1343 aa  244  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  32.91 
 
 
993 aa  243  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 
1341 aa  241  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 
934 aa  241  9e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  35.22 
 
 
1373 aa  239  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  32.68 
 
 
1400 aa  236  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  35.7 
 
 
876 aa  237  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  35.84 
 
 
1311 aa  235  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 
975 aa  234  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  33.88 
 
 
1384 aa  232  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.54 
 
 
1301 aa  231  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02240  protein-histidine kinase, putative  30.07 
 
 
1816 aa  229  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  33.33 
 
 
1378 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  31.87 
 
 
816 aa  225  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
978 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  32.46 
 
 
1344 aa  225  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  31.66 
 
 
816 aa  224  6e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  33.7 
 
 
1373 aa  224  8e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  34.36 
 
 
1370 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  35.28 
 
 
1335 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  33.41 
 
 
1298 aa  222  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  34.31 
 
 
1397 aa  222  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  33.73 
 
 
1306 aa  221  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  32.09 
 
 
1366 aa  221  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  33.49 
 
 
863 aa  219  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  34.23 
 
 
663 aa  219  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1423  response regulator receiver (CheY) and GAF domain-containing protein  43.32 
 
 
315 aa  217  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  33.57 
 
 
1355 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
677 aa  215  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  31.87 
 
 
1355 aa  214  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 
940 aa  214  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  32.1 
 
 
961 aa  214  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
837 aa  213  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  33.73 
 
 
1374 aa  213  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  29.39 
 
 
904 aa  212  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  30.27 
 
 
1378 aa  212  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 
882 aa  211  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  31.6 
 
 
1363 aa  211  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  32.25 
 
 
1344 aa  211  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  32.02 
 
 
1418 aa  211  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 
896 aa  210  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  31.31 
 
 
1374 aa  209  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  31.26 
 
 
896 aa  207  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 
853 aa  207  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  31.2 
 
 
896 aa  206  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  31.04 
 
 
896 aa  206  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
979 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  31.26 
 
 
896 aa  205  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>