More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3105 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3105  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 
324 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.345406  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  44.74 
 
 
330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  43.83 
 
 
338 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  43.75 
 
 
323 aa  271  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  45.17 
 
 
333 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  42.58 
 
 
322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  40.95 
 
 
341 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  44.48 
 
 
334 aa  268  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  40.85 
 
 
340 aa  265  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  41.5 
 
 
336 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  43.61 
 
 
315 aa  265  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  40.52 
 
 
336 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  43.35 
 
 
321 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  40.52 
 
 
337 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  42.04 
 
 
325 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  41.72 
 
 
325 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  43.18 
 
 
338 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  40.2 
 
 
340 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  41.04 
 
 
338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  42.28 
 
 
329 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  42.16 
 
 
320 aa  256  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  40.45 
 
 
337 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  43.65 
 
 
326 aa  256  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  42.07 
 
 
331 aa  255  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  42.01 
 
 
323 aa  255  9e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  40.39 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  40.39 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  43.61 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  42.17 
 
 
323 aa  252  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  41.01 
 
 
333 aa  252  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  41.01 
 
 
359 aa  251  9.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  43.56 
 
 
307 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  41.94 
 
 
328 aa  250  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  39.81 
 
 
341 aa  248  8e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  40.45 
 
 
321 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  39.41 
 
 
339 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  41.83 
 
 
320 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  41.83 
 
 
320 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  44.28 
 
 
366 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  41.19 
 
 
323 aa  247  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  40.78 
 
 
331 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2608  KpsF/GutQ family protein  41.31 
 
 
315 aa  246  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  43 
 
 
326 aa  245  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  40.06 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  41.61 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  42.16 
 
 
353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  40.45 
 
 
320 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  40.13 
 
 
321 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  41.3 
 
 
333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2580  KpsF/GutQ family protein  42.19 
 
 
339 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597133  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  40.76 
 
 
321 aa  242  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  40.52 
 
 
328 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  39.13 
 
 
331 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  46.02 
 
 
330 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  40.82 
 
 
325 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  40.65 
 
 
326 aa  240  2e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.54 
 
 
328 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  40.65 
 
 
324 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3307  KpsF/GutQ family protein  39.44 
 
 
331 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  40.51 
 
 
345 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  40.65 
 
 
324 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  40.39 
 
 
324 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  42.3 
 
 
330 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  41.29 
 
 
324 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  41.37 
 
 
332 aa  238  9e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  41.96 
 
 
330 aa  238  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  41.16 
 
 
363 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  41.31 
 
 
321 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  37.54 
 
 
326 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  40.32 
 
 
328 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  41.1 
 
 
323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  41.04 
 
 
324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.55 
 
 
328 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  39.55 
 
 
328 aa  236  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.55 
 
 
328 aa  236  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  44.67 
 
 
330 aa  236  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.55 
 
 
328 aa  236  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.55 
 
 
328 aa  236  6e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.55 
 
 
328 aa  236  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  39.55 
 
 
328 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.55 
 
 
328 aa  236  6e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  39.55 
 
 
328 aa  235  7e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  40.32 
 
 
324 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  40.52 
 
 
325 aa  235  7e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  40.82 
 
 
325 aa  235  8e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  41.67 
 
 
340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  40.13 
 
 
357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  39.87 
 
 
325 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  41.32 
 
 
330 aa  233  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  39.87 
 
 
325 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  41.1 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  40.72 
 
 
326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  39.87 
 
 
325 aa  232  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  40 
 
 
326 aa  232  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3722  capsule expression protein  41.51 
 
 
331 aa  232  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  38.26 
 
 
328 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  38.85 
 
 
321 aa  232  6e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  40.51 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  41.04 
 
 
326 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  40.57 
 
 
325 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>