More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3084 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3084  phage integrase  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2651  integrase/recombinase  43.09 
 
 		 320 aa  149  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.178628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  31.46 
 
 		 295 aa  94  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  32.56 
 
 		 309 aa  92.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  36.75 
 
 		 298 aa  91.7  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  31.94 
 
 		 298 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  30.86 
 
 		 302 aa  88.2  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.53 
 
 		 296 aa  88.2  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.94 
 
 		 296 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.94 
 
 		 296 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.94 
 
 		 296 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.94 
 
 		 296 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.94 
 
 		 296 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  31.33 
 
 		 296 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.55 
 
 		 306 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  30.56 
 
 		 295 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.94 
 
 		 296 aa  87  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.94 
 
 		 296 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.94 
 
 		 296 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.94 
 
 		 296 aa  87  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  31.52 
 
 		 295 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.55 
 
 		 306 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  28.99 
 
 		 304 aa  86.7  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.55 
 
 		 306 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  32.57 
 
 		 303 aa  86.3  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.51 
 
 		 298 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.53 
 
 		 299 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  35.03 
 
 		 298 aa  86.3  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.53 
 
 		 296 aa  85.5  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.11 
 
 		 302 aa  85.1  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  33.73 
 
 		 284 aa  85.1  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  32.89 
 
 		 291 aa  85.1  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  30.17 
 
 		 292 aa  85.1  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 298 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  35.57 
 
 		 299 aa  85.1  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.98 
 
 		 306 aa  84.7  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.48 
 
 		 306 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 298 aa  84.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  34.23 
 
 		 301 aa  84.7  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  30.81 
 
 		 277 aa  84.7  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  27.32 
 
 		 309 aa  84.3  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.78 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  33.78 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.78 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.78 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.46 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.78 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  33.78 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.78 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.78 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  31.11 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.42 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.43 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  31.4 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.03 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  31.03 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.03 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.42 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  31.61 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.03 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.03 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.03 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.03 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.03 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  35.03 
 
 		 332 aa  82  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  34.9 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.9 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.78 
 
 		 302 aa  81.6  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.9 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  32.32 
 
 		 302 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.43 
 
 		 298 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.84 
 
 		 306 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  34.23 
 
 		 296 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3973  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.43 
 
 		 311 aa  81.3  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.556004  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  32.79 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1146  tyrosine recombinase XerD  29.19 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  31.93 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  32.56 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  29.94 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  32.16 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  31.76 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.43 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  27.01 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.53 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.24 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  29.35 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  32.93 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  34.23 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  32.02 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  31.46 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  32.95 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  29.89 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.76 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.67 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 303 aa  78.6  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0201  tyrosine recombinase XerC subunit  32.89 
 
 		 345 aa  78.6  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601095 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  29.09 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  33.13 
 
 		 314 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 303 aa  78.6  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.67 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>