More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3008 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  100 
 
 		 91 aa  189  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  88.04 
 
 		 92 aa  167  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  88.04 
 
 		 92 aa  166  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  83.7 
 
 		 92 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  78.02 
 
 		 91 aa  161  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 		 95 aa  155  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 		 92 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  78.26 
 
 		 92 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  78.26 
 
 		 92 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  79.12 
 
 		 91 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17361  30S ribosomal protein S19  75.82 
 
 		 91 aa  150  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17451  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 		 92 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17611  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 		 92 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1646  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 92 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 92 aa  147  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23061  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 		 91 aa  147  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1125  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 91 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19991  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 91 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.380662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  76.19 
 
 		 94 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16741  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 91 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  74.73 
 
 		 91 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  73.91 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  75.29 
 
 		 94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  73.91 
 
 		 93 aa  144  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 		 93 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 93 aa  144  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 		 93 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  73.91 
 
 		 92 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  69.66 
 
 		 94 aa  144  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 		 93 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0372  30S ribosomal protein S19  73.63 
 
 		 91 aa  144  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 93 aa  144  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  74.73 
 
 		 92 aa  144  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 91 aa  144  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 93 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 93 aa  143  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 93 aa  143  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 		 93 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 93 aa  143  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  72.83 
 
 		 92 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1959  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 91 aa  142  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  70.79 
 
 		 93 aa  143  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 92 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 92 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 92 aa  142  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 93 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  68.54 
 
 		 93 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  71.74 
 
 		 93 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 94 aa  141  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  140  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  70.65 
 
 		 93 aa  140  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  140  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  71.43 
 
 		 92 aa  140  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1344  ribosomal protein S19  70 
 
 		 90 aa  140  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 91 aa  140  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  140  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 93 aa  140  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0935  ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 93 aa  139  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 91 aa  139  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 91 aa  140  9e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0854  ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 91 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  71.43 
 
 		 94 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  70.65 
 
 		 93 aa  139  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  68.13 
 
 		 94 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  70.33 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 		 92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 		 92 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 		 92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 		 92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 		 92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  70 
 
 		 98 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  67.03 
 
 		 93 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4311  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 93 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3919  30S ribosomal protein S19  71.74 
 
 		 93 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 		 92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  68.48 
 
 		 92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 		 92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 92 aa  138  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 		 92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 		 92 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0630  ribosomal protein S19  72.53 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000445779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>