More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2999 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  81.95 
 
 		 133 aa  229  7.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  80.45 
 
 		 133 aa  224  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  75.94 
 
 		 133 aa  214  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  72.93 
 
 		 133 aa  213  9e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  75.19 
 
 		 133 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0236  30S ribosomal protein S8  75.94 
 
 		 133 aa  200  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.88489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0239  30S ribosomal protein S8  75.94 
 
 		 133 aa  200  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23161  30S ribosomal protein S8  65.41 
 
 		 133 aa  193  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1968  30S ribosomal protein S8  66.17 
 
 		 133 aa  191  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0363  30S ribosomal protein S8  65.41 
 
 		 133 aa  191  4e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16651  30S ribosomal protein S8  63.91 
 
 		 133 aa  190  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1116  30S ribosomal protein S8  66.67 
 
 		 133 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19901  30S ribosomal protein S8  65.91 
 
 		 133 aa  187  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17361  30S ribosomal protein S8  63.16 
 
 		 133 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1637  30S ribosomal protein S8  63.16 
 
 		 133 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17271  30S ribosomal protein S8  63.91 
 
 		 133 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17521  30S ribosomal protein S8  63.16 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  60.47 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  57.89 
 
 		 132 aa  157  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  58.46 
 
 		 131 aa  156  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 		 132 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  55.22 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  53.38 
 
 		 132 aa  151  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  57.89 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 		 132 aa  151  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  54.89 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  56.39 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  150  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  51.88 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  53.68 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 133 aa  148  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  56.39 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0162  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0309  ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000138309  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2160  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 130 aa  146  9e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  53.73 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  54.48 
 
 		 133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3283  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000196614  hitchhiker  0.00000244921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  53.03 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  51.88 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4156  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000345166  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000315626  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000497619  decreased coverage  0.00000000000124793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0210  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000163512  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2936  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000152051  hitchhiker  0.000000826655 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0214  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000354136  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4042  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  unclonable  0.00000000000313714 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 131 aa  145  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3005  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00104823  normal  0.0533117 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  52.9 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0227  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000103227  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00744  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09860  SSU ribosomal protein S8P  51.13 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00958102  hitchhiker  0.0000136856 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  51.16 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0184  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050833  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 		 132 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  53.68 
 
 		 135 aa  143  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  54.41 
 
 		 135 aa  143  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3429  SSU ribosomal protein S8P  52.27 
 
 		 131 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401313  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  53.68 
 
 		 136 aa  143  8.000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>