More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2959 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2959  GTP-binding protein Era  100 
 
 
310 aa  622  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000390486  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1611  GTP-binding protein Era  73.87 
 
 
318 aa  472  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4517  GTP-binding protein Era  74.68 
 
 
337 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3560  GTP-binding protein Era  70.53 
 
 
314 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2546  GTP-binding protein Era  70.86 
 
 
314 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4483  GTP-binding protein Era  71.95 
 
 
318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  73.36 
 
 
315 aa  431  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0160  GTP-binding protein Era  69.97 
 
 
311 aa  424  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.709103  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19471  GTP-binding protein Era  56.72 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1511  GTP-binding protein Era  57.24 
 
 
319 aa  326  3e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0887  GTP-binding protein Era  56.81 
 
 
311 aa  325  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13281  GTP-binding protein Era-like protein  56.29 
 
 
314 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.593826 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0848  GTP-binding protein Era  51.83 
 
 
313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17011  GTP-binding protein Era  51.83 
 
 
313 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.205656  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1377  GTP-binding protein Era  51.83 
 
 
303 aa  305  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0974001  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14421  GTP-binding protein Era  51 
 
 
303 aa  299  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  49.66 
 
 
303 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  48.33 
 
 
302 aa  290  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 
303 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  49.5 
 
 
303 aa  290  1e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  48.81 
 
 
301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  47.32 
 
 
303 aa  285  5.999999999999999e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  48.67 
 
 
302 aa  285  8e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  49.33 
 
 
301 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  47.16 
 
 
300 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  47.99 
 
 
302 aa  279  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  47.67 
 
 
303 aa  278  6e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  48.83 
 
 
301 aa  278  8e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  48.32 
 
 
301 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  47.52 
 
 
300 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  46.28 
 
 
298 aa  277  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  48.49 
 
 
301 aa  276  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  48.49 
 
 
301 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  48.49 
 
 
301 aa  276  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  48.49 
 
 
301 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  48.49 
 
 
301 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  48.49 
 
 
301 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  47.04 
 
 
299 aa  275  5e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 
299 aa  275  9e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  48.16 
 
 
301 aa  275  9e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  48.16 
 
 
301 aa  275  9e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  47.26 
 
 
299 aa  275  9e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  48.46 
 
 
297 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  48.32 
 
 
305 aa  270  2e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  46.94 
 
 
299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  48.12 
 
 
298 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  45.89 
 
 
299 aa  268  8e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  45.07 
 
 
299 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 
303 aa  263  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  45.05 
 
 
297 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 
294 aa  259  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  45.64 
 
 
298 aa  259  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  45.51 
 
 
305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  48.83 
 
 
301 aa  256  3e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  42.05 
 
 
302 aa  255  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  44.59 
 
 
303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  47.51 
 
 
449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  47.18 
 
 
451 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  44.15 
 
 
306 aa  252  6e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  43.73 
 
 
293 aa  252  7e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  43.29 
 
 
324 aa  251  9.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  45.79 
 
 
297 aa  250  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  45.67 
 
 
300 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  45.02 
 
 
301 aa  247  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  44.78 
 
 
296 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  44.04 
 
 
307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  43.14 
 
 
296 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  43.34 
 
 
300 aa  242  7e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1205  GTP-binding protein Era  44.07 
 
 
297 aa  241  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.124977  normal  0.282602 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07630  GTP-binding protein Era  42.18 
 
 
315 aa  241  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.718236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3235  GTP-binding protein Era  41.35 
 
 
489 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00276402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  43.34 
 
 
299 aa  239  5e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1640  GTP-binding protein Era  39.67 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0258714  hitchhiker  0.00261121 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  42.09 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3787  GTP-binding protein Era  42.91 
 
 
468 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.0434052 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  40.14 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  40.14 
 
 
296 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  40.59 
 
 
310 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  40.26 
 
 
310 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0332  GTP-binding protein Era  41.3 
 
 
293 aa  229  5e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 
310 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  39.6 
 
 
310 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1323  GTP-binding protein Era  40.96 
 
 
298 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0411499  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3463  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 
299 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.720109  normal  0.032958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3452  GTP-binding protein Era  42.09 
 
 
299 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00911502  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3515  GTP-binding protein Era  42.09 
 
 
299 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  40 
 
 
303 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  42.18 
 
 
303 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12970  GTP-binding protein Era  41.89 
 
 
301 aa  223  4e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.141984 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0507  GTP-binding protein Era  39.39 
 
 
301 aa  223  4e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000333853  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  40.61 
 
 
315 aa  222  6e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl266  GTP-binding protein Era  41.22 
 
 
301 aa  221  9e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  6.59888e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4623  GTP-binding protein Era  41.67 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236944  hitchhiker  0.0010995 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0791  GTP-binding protein Era  38.59 
 
 
312 aa  221  9.999999999999999e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000010193  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  41.06 
 
 
305 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  40.67 
 
 
304 aa  219  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1743  GTP-binding protein Era  41.24 
 
 
293 aa  219  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  40.14 
 
 
299 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>