More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2870 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
219 aa  448  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  67.62 
 
 
213 aa  293  9e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  66.5 
 
 
209 aa  290  9e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  64.18 
 
 
202 aa  281  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  64.18 
 
 
202 aa  281  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  62.38 
 
 
210 aa  275  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  58.79 
 
 
213 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  57.87 
 
 
208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  51.3 
 
 
186 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  51.79 
 
 
206 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  50.26 
 
 
207 aa  191  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  49.74 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  49.74 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  49.74 
 
 
210 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  49.74 
 
 
186 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  49.74 
 
 
207 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  49.74 
 
 
186 aa  188  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  49.74 
 
 
186 aa  188  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  49.74 
 
 
207 aa  188  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  49.74 
 
 
186 aa  188  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  47.96 
 
 
206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  47.32 
 
 
205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  49.48 
 
 
206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  45.6 
 
 
191 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  47.4 
 
 
188 aa  181  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  46.15 
 
 
188 aa  177  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  46.15 
 
 
188 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  49.21 
 
 
184 aa  175  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.31 
 
 
190 aa  175  6e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.27 
 
 
187 aa  174  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  46.35 
 
 
186 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  48.44 
 
 
185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  43.59 
 
 
202 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  44.9 
 
 
189 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  46.35 
 
 
196 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  43.59 
 
 
202 aa  168  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  45.88 
 
 
195 aa  168  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  44.79 
 
 
186 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.81 
 
 
206 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.31 
 
 
183 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.37 
 
 
191 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  42.05 
 
 
189 aa  158  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  46.11 
 
 
190 aa  157  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  45.08 
 
 
190 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.67 
 
 
195 aa  155  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  41.12 
 
 
180 aa  155  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  42.49 
 
 
191 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  43.15 
 
 
189 aa  155  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02831  peptidyl-tRNA hydrolase  42.94 
 
 
199 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.396706  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 
188 aa  154  8e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 
214 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  44.04 
 
 
190 aa  153  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  44.56 
 
 
190 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  42.27 
 
 
186 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  40.31 
 
 
189 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  45.55 
 
 
194 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  46.08 
 
 
196 aa  151  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  40.98 
 
 
199 aa  150  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.03 
 
 
187 aa  150  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  40.93 
 
 
189 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 
199 aa  150  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.2 
 
 
199 aa  149  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  41.75 
 
 
186 aa  149  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  40.41 
 
 
189 aa  149  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf853  peptidyl-tRNA hydrolase  39.58 
 
 
181 aa  149  4e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1474  peptidyl-tRNA hydrolase  41.75 
 
 
188 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0138891 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1510  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.46 
 
 
193 aa  148  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02721  peptidyl-tRNA hydrolase  43.18 
 
 
200 aa  148  7e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.778009  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  42.93 
 
 
189 aa  148  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1364  peptidyl-tRNA hydrolase  42.49 
 
 
179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  41.15 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  43.5 
 
 
190 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  43.26 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  40.41 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  43.26 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3654  peptidyl-tRNA hydrolase  39.8 
 
 
201 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000443892  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0954  peptidyl-tRNA hydrolase  40.51 
 
 
188 aa  146  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000191784  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 
206 aa  145  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  38.89 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  38.89 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  40.72 
 
 
188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  37.82 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  37.82 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  37.82 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  40.62 
 
 
189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  40.78 
 
 
365 aa  144  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0745  peptidyl-tRNA hydrolase  41.62 
 
 
193 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0688504  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  41.3 
 
 
205 aa  142  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  43.26 
 
 
192 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  36.1 
 
 
214 aa  142  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  40.59 
 
 
217 aa  141  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2286  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.86 
 
 
194 aa  141  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02731  peptidyl-tRNA hydrolase  41.71 
 
 
198 aa  141  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  37.56 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2128  peptidyl-tRNA hydrolase  35.15 
 
 
201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  37.23 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0663  peptidyl-tRNA hydrolase  41.33 
 
 
193 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.741399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3680  peptidyl-tRNA hydrolase  38.78 
 
 
191 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00255338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>