216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2865 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2865  beta-lactamase-like  100 
 
 
304 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.627483  normal  0.13634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2117  Beta-lactamase-like  58.66 
 
 
298 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3257  beta-lactamase domain-containing protein  59.01 
 
 
308 aa  378  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2311  beta-lactamase domain protein  59.78 
 
 
285 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4027  beta-lactamase domain protein  59.86 
 
 
296 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.961759 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2260  beta-lactamase domain protein  59.78 
 
 
285 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1865  beta-lactamase-like  58.91 
 
 
305 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523835  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2383  beta-lactamase domain-containing protein  59.63 
 
 
320 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4637  beta-lactamase-like  56 
 
 
301 aa  355  3.9999999999999996e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3546  hypothetical protein  45.3 
 
 
299 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.285484  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0338  beta-lactamase-like protein  44.09 
 
 
275 aa  247  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2700  hypothetical protein  42.5 
 
 
301 aa  237  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0550  beta-lactamase domain protein  39.48 
 
 
278 aa  228  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.145975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4119  hypothetical protein  38.99 
 
 
284 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376643  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4229  beta-lactamase domain protein  39.48 
 
 
309 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3638  beta-lactamase domain protein  35.94 
 
 
309 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  hitchhiker  0.00134063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  40.59 
 
 
603 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0591  beta-lactamase domain-containing protein  36.75 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1985  beta-lactamase-like  38.46 
 
 
295 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7099  putative hydrolase protein, beta-lactamase superfamily  37.09 
 
 
276 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760297  normal  0.767931 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5955  beta-lactamase domain protein  39.7 
 
 
276 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.512599  normal  0.0645394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  41.34 
 
 
607 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5603  metal dependant beta lactamase protein  35.92 
 
 
276 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1811  Beta-lactamase-like  36.63 
 
 
282 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4587  beta-lactamase domain-containing protein  39.57 
 
 
276 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205047  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3215  beta-lactamase domain-containing protein  35.25 
 
 
295 aa  185  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0048  beta-lactamase domain-containing protein  38.33 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6341  beta-lactamase domain protein  35.31 
 
 
322 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1047  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4970  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 
301 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0202653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0627  hypothetical protein  34.87 
 
 
305 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0276  beta-lactamase domain-containing protein  33.69 
 
 
308 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6342  beta-lactamase domain protein  37.06 
 
 
284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2334  beta-lactamase domain-containing protein  35.07 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1257  ElaC, metal-dependent hydrolase of the beta- lactamase superfamily  34.06 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4228  beta-lactamase domain protein  36.12 
 
 
283 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.470343  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1486  metal-dependent hydrolase  34.42 
 
 
279 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2296  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
302 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.557207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4920  beta-lactamase domain protein  32.27 
 
 
301 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4456  beta-lactamase domain-containing protein  32.27 
 
 
349 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02966  beta-lactamase-like protein  33.08 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1275  beta-lactamase-like  32.26 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1541  metallo-beta-lactamase family protein  31.85 
 
 
320 aa  132  6.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0060  beta-lactamase domain protein  31.68 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2297  metal-dependent hydrolase  33.57 
 
 
280 aa  125  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3807  beta-lactamase superfamily hydrolase  27.81 
 
 
323 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1236  beta-lactamase superfamily hydrolase  28.09 
 
 
320 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0138314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1994  metallo-beta-lactamase family protein  28.81 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0701342  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0652  beta-lactamase domain-containing protein  28.31 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1558  sulphohydrolase/glycosulfatase, Zn-dependent hydrolase  26.85 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.136554  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2011  ribonuclease Z  24.07 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0495  hypothetical protein  27.18 
 
 
235 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.78198  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20060  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  26.75 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204616  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2095  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  26.4 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  24.32 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  29.62 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  25.62 
 
 
256 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1710  beta-lactamase domain-containing protein  27.37 
 
 
235 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.635275  normal  0.117581 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0441  beta-lactamase domain protein  23.13 
 
 
259 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  26.2 
 
 
323 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  25.32 
 
 
308 aa  63.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  23.46 
 
 
305 aa  63.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  25.73 
 
 
251 aa  63.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0920  RNAse Z  22.39 
 
 
314 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.63 
 
 
314 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.529395  normal  0.726567 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  24.56 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1966  beta-lactamase domain protein  23.83 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  27.85 
 
 
251 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  23.4 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  26.41 
 
 
280 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  27.16 
 
 
268 aa  60.1  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0190  beta-lactamase domain-containing protein  22.87 
 
 
258 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0700  beta-lactamase domain protein  24.71 
 
 
270 aa  59.7  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  22.01 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  23.69 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11369  hypothetical protein  27 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0204718  normal  0.45111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  23.05 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  27.75 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  26.67 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  24.38 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  24.39 
 
 
322 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  23.92 
 
 
301 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  22.26 
 
 
314 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0641  ribonuclease Z  23.15 
 
 
321 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.56652  decreased coverage  0.00172895 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  26.6 
 
 
235 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4523  ribonuclease Z  24.1 
 
 
315 aa  56.6  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0967083  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15101  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.21 
 
 
312 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3611  ribonuclease Z  24.38 
 
 
314 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2503  ribonuclease Z  24.38 
 
 
314 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  27.34 
 
 
320 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2403  ribonuclease Z  23.69 
 
 
345 aa  55.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335232  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  22.98 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0871  beta-lactamase-like  26.42 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15351  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.28 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  27.08 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14031  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.94 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.694516  normal  0.113121 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  24.45 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  27.96 
 
 
323 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  21.05 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0844  cyclic-AMP phosphodiesterase  23.04 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>