More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2811 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  63.94 
 
 
985 aa  822    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
782 aa  1558    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  42.51 
 
 
1060 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  38.88 
 
 
1313 aa  412  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  38.07 
 
 
1266 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.74 
 
 
991 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  40.68 
 
 
941 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  33.87 
 
 
2145 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  33.43 
 
 
1450 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  28.62 
 
 
1914 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  33.5 
 
 
725 aa  308  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  35.36 
 
 
1238 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  34.33 
 
 
957 aa  270  8e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
1261 aa  249  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  44.49 
 
 
1101 aa  249  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 
1714 aa  249  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  41.22 
 
 
828 aa  241  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  31.36 
 
 
1009 aa  232  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  28.08 
 
 
1328 aa  226  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  40.72 
 
 
408 aa  224  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 
1186 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  30.13 
 
 
1040 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  26.11 
 
 
1507 aa  217  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
1215 aa  216  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 
1526 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 
1162 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  36.15 
 
 
412 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  29.98 
 
 
1550 aa  206  2e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
1162 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 
1596 aa  204  8e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  42.31 
 
 
1063 aa  200  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  21.29 
 
 
1180 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.5 
 
 
636 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.15 
 
 
1022 aa  194  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.4 
 
 
1056 aa  193  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.14 
 
 
988 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  31.63 
 
 
340 aa  189  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  28.19 
 
 
799 aa  188  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  26.32 
 
 
836 aa  186  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.07 
 
 
1056 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  41.06 
 
 
689 aa  185  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 
343 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 
1025 aa  180  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  28.31 
 
 
1044 aa  178  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  30.5 
 
 
1288 aa  175  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.89 
 
 
810 aa  174  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.95 
 
 
1424 aa  174  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
878 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.7 
 
 
818 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.43 
 
 
694 aa  171  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  31.1 
 
 
1404 aa  169  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
923 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  30.72 
 
 
364 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 
438 aa  165  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 
454 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  26.92 
 
 
2327 aa  163  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  24.57 
 
 
740 aa  162  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  29.85 
 
 
809 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.5 
 
 
784 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.43 
 
 
771 aa  160  8e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.7 
 
 
609 aa  159  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  32.89 
 
 
825 aa  157  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  25.5 
 
 
708 aa  157  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.61 
 
 
1676 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  27.25 
 
 
1147 aa  153  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.97 
 
 
885 aa  152  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.44 
 
 
1279 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.78 
 
 
767 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  38.28 
 
 
833 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.08 
 
 
852 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  28.19 
 
 
1039 aa  147  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.02 
 
 
787 aa  147  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 
1105 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 
568 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.02 
 
 
568 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  29.07 
 
 
1020 aa  142  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  36.17 
 
 
490 aa  142  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  28.39 
 
 
1054 aa  142  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 
949 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  31.31 
 
 
834 aa  141  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.96 
 
 
1291 aa  140  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.41 
 
 
1429 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  25.78 
 
 
755 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  29.33 
 
 
357 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 
1285 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
649 aa  134  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  21.65 
 
 
1050 aa  133  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  30.25 
 
 
971 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.09 
 
 
732 aa  130  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 
843 aa  130  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  26.69 
 
 
992 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  29.78 
 
 
919 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.95 
 
 
1295 aa  129  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  26.01 
 
 
1048 aa  129  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
659 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
1298 aa  128  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  26.92 
 
 
493 aa  128  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  28.94 
 
 
827 aa  127  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1113  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
478 aa  127  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0928766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  33.6 
 
 
872 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>