More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2809 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
985 aa  1948    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  68.31 
 
 
782 aa  821    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  40.27 
 
 
1060 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  37.12 
 
 
1266 aa  361  5e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  37.63 
 
 
1313 aa  350  5e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  30.72 
 
 
2145 aa  341  4e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.17 
 
 
991 aa  317  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  36.83 
 
 
941 aa  267  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  27.77 
 
 
1450 aa  264  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
1261 aa  251  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  32.01 
 
 
725 aa  242  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  29.68 
 
 
957 aa  229  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  44.26 
 
 
408 aa  222  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  22.38 
 
 
1914 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  39.46 
 
 
828 aa  215  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  41.57 
 
 
1101 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  31.22 
 
 
1238 aa  197  9e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.23 
 
 
1162 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  30.68 
 
 
1009 aa  190  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
1162 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
412 aa  181  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  43.46 
 
 
689 aa  180  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.6 
 
 
1186 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
927 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.32 
 
 
1056 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  31.73 
 
 
340 aa  170  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.18 
 
 
1022 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.69 
 
 
1040 aa  165  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  38 
 
 
1063 aa  165  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  28.54 
 
 
1550 aa  166  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 
1526 aa  164  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.79 
 
 
636 aa  164  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  33.68 
 
 
364 aa  163  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 
343 aa  161  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 
923 aa  157  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.36 
 
 
1056 aa  154  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 
878 aa  151  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.38 
 
 
818 aa  151  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.01 
 
 
1694 aa  150  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
1025 aa  149  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.38 
 
 
988 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.23 
 
 
1676 aa  141  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  21.97 
 
 
1714 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.7 
 
 
810 aa  138  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  31.27 
 
 
825 aa  137  9e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  24.75 
 
 
1328 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  31.23 
 
 
357 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  30.04 
 
 
1020 aa  131  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  28.65 
 
 
1404 aa  129  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.8 
 
 
784 aa  127  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.84 
 
 
809 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.6 
 
 
609 aa  125  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  29.18 
 
 
1054 aa  125  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  28.9 
 
 
834 aa  125  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 
1279 aa  124  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 
852 aa  124  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2043  tetratricopeptide domain-containing protein  22.94 
 
 
1497 aa  124  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  19.21 
 
 
1180 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  24.13 
 
 
1507 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
1596 aa  120  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0621  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 
368 aa  117  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 
833 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
1215 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  27.72 
 
 
573 aa  115  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.62 
 
 
732 aa  115  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  25.25 
 
 
1048 aa  114  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 
949 aa  114  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  30.3 
 
 
1228 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  25.95 
 
 
755 aa  111  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 
1276 aa  111  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  23.58 
 
 
1147 aa  110  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  29.55 
 
 
962 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  26.33 
 
 
493 aa  108  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 
543 aa  107  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.2 
 
 
758 aa  107  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.07 
 
 
936 aa  107  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
659 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  30.63 
 
 
971 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.25 
 
 
1291 aa  107  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.18 
 
 
885 aa  105  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  29.29 
 
 
799 aa  106  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
850 aa  105  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  23.37 
 
 
740 aa  105  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 
602 aa  104  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  32.09 
 
 
490 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  27.76 
 
 
981 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.42 
 
 
1295 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.12 
 
 
771 aa  102  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 
760 aa  101  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
1911 aa  101  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  28.91 
 
 
650 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  26.69 
 
 
992 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  29.91 
 
 
919 aa  100  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
568 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.22 
 
 
560 aa  99.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  25.69 
 
 
790 aa  99.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.33 
 
 
568 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  23.17 
 
 
836 aa  100  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  31.96 
 
 
775 aa  99.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>