More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2800 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  100 
 
 
342 aa  712    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  44.25 
 
 
324 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  43.11 
 
 
371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  40.29 
 
 
367 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  42.51 
 
 
358 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  40.82 
 
 
360 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  40.82 
 
 
360 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  40.84 
 
 
335 aa  177  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  68.09 
 
 
157 aa  139  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  63.92 
 
 
270 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  60 
 
 
199 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  49.23 
 
 
239 aa  132  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  66.3 
 
 
238 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  64.13 
 
 
163 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  64.84 
 
 
262 aa  131  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  54.95 
 
 
163 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  50.38 
 
 
170 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  63.04 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  67.42 
 
 
122 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  44.3 
 
 
265 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  61.8 
 
 
140 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  60 
 
 
275 aa  126  6e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  60 
 
 
275 aa  126  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  54.47 
 
 
179 aa  125  7e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  58.16 
 
 
211 aa  126  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  60.2 
 
 
200 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  60 
 
 
266 aa  125  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  58.16 
 
 
242 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  66.29 
 
 
122 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  58.16 
 
 
230 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  58.16 
 
 
242 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  57.43 
 
 
199 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  58.16 
 
 
230 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  59.55 
 
 
303 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  58.16 
 
 
211 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  46.56 
 
 
267 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  65.91 
 
 
121 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  58.16 
 
 
211 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  58.16 
 
 
211 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  62.37 
 
 
240 aa  124  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  62.92 
 
 
121 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  62.37 
 
 
286 aa  124  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  50 
 
 
238 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  44.3 
 
 
263 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  61.7 
 
 
212 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  58.16 
 
 
323 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  58.16 
 
 
200 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  52.8 
 
 
196 aa  122  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  48.39 
 
 
265 aa  122  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  59.6 
 
 
121 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  62.37 
 
 
270 aa  122  9e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
165 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  46.15 
 
 
267 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  48.76 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  56.78 
 
 
221 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  64.13 
 
 
322 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  55.34 
 
 
202 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  55.1 
 
 
264 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
246 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
120 aa  119  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  56.84 
 
 
324 aa  119  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  61 
 
 
337 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
259 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  56.7 
 
 
168 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  45.08 
 
 
153 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  53.64 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  58.33 
 
 
408 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  55.43 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  57.45 
 
 
264 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  62.64 
 
 
125 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  65.48 
 
 
213 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  62.37 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  62.64 
 
 
125 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  57.29 
 
 
254 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  62.64 
 
 
162 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
253 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  62.37 
 
 
342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
124 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  61.8 
 
 
261 aa  116  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  58.24 
 
 
167 aa  116  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  60.64 
 
 
163 aa  116  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  58.16 
 
 
339 aa  116  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  56.84 
 
 
270 aa  116  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  48.36 
 
 
364 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  55.17 
 
 
186 aa  115  7.999999999999999e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  58.89 
 
 
150 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  45.21 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  61.8 
 
 
124 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  53.54 
 
 
124 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  53.06 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  55.91 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  53.54 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  55.67 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  53.61 
 
 
213 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  56.84 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  50.43 
 
 
142 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  53.61 
 
 
213 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  53.61 
 
 
203 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>