125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2782 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2782  cobalt transport protein CbiM  100 
 
 
214 aa  415  1e-115  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104857  decreased coverage  0.00186647 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2022  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.09 
 
 
197 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  9.20884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3139  cobalt transport protein CbiM  36.79 
 
 
204 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1190  cobalt transport protein CbiM  37.09 
 
 
204 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  4.65772e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3500  cobalt transport protein CbiM  36.65 
 
 
211 aa  121  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1959  cobalt transport protein CbiM  36.02 
 
 
208 aa  117  1e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3436  cobalt transport protein CbiM  36.62 
 
 
203 aa  113  2e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.790482  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3138  cobalt transport protein CbiM  38.97 
 
 
208 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.74 
 
 
430 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0756  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.64 
 
 
204 aa  111  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.535261  normal  0.785347 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1951  cobalt transport protein CbiM  34.43 
 
 
211 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70301  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1133  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  38.32 
 
 
198 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.540876 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0543  cobalt transport protein CbiM  37.38 
 
 
193 aa  103  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1365  cobalt transport protein CbiM  36.11 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1321  cobalt transport protein CbiM  36.11 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2093  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  33.8 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00179951  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1346  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  37.74 
 
 
198 aa  95.9  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0137458  unclonable  1.05881e-06 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2474  cobalt transport protein CbiM  33.02 
 
 
201 aa  95.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1936  cobalt transport protein CbiM  37.26 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0557  cobalt transport protein CbiM  31.6 
 
 
195 aa  91.7  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.583466  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0171  cobalt transport protein CbiM  33.96 
 
 
194 aa  86.3  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3207  cobalt transport protein CbiM  33.02 
 
 
205 aa  81.6  8e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1739  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.63 
 
 
204 aa  74.7  9e-13  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.749284  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0097  cobalt transport protein CbiM  31.34 
 
 
225 aa  73.9  1e-12  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3947  cobalt transport protein CbiM  33.02 
 
 
205 aa  74.7  1e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1702  cobalamin biosynthesis protein CbiM  31.36 
 
 
231 aa  73.2  3e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.254913  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1471  cobalt transport protein CbiM  34.11 
 
 
207 aa  72.4  5e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.699456  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2131  cobalt transport protein CbiM  30 
 
 
197 aa  72  7e-12  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1193  cobalt transport protein CbiM  30.41 
 
 
225 aa  71.6  8e-12  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0273  cobalt transport protein CbiM  40.68 
 
 
231 aa  70.9  1e-11  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163023  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0790  cobalt transport protein CbiM  31.02 
 
 
225 aa  70.9  1e-11  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3808  cobalt transport protein CbiM  31.08 
 
 
245 aa  69.7  3e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0725  cobalt transport protein CbiM  31.8 
 
 
225 aa  69.3  5e-11  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.145999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3892  cobalt transport protein CbiM  30.63 
 
 
256 aa  65.5  5e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.885543 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1085  hypothetical protein  29.68 
 
 
231 aa  65.1  7e-10  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3004  cobalt transport protein CbiM  28.38 
 
 
321 aa  65.1  7e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0192  cobalt transport protein CbiM  29.46 
 
 
230 aa  64.7  9e-10  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0108763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2145  cobalt transport protein CbiM  28.12 
 
 
235 aa  64.3  1e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0808457  normal  0.37009 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1060  cobalt transport protein CbiM  33.63 
 
 
254 aa  64.7  1e-09  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  30.6 
 
 
599 aa  63.5  2e-09  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1700  cobalt transport protein CbiM  30.49 
 
 
231 aa  63.2  3e-09  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  1.12913e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1385  cobalamin biosynthesis protein CbiM  31.8 
 
 
250 aa  60.8  2e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1709  cobalamin biosynthesis protein CbiM  29.67 
 
 
248 aa  60.1  2e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1293  cobalamin biosynthesis protein CbiM  28.82 
 
 
232 aa  60.5  2e-08  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034572  normal  0.0275766 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1003  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.37 
 
 
236 aa  60.1  3e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1959  cobalt transport protein CbiM  26.13 
 
 
226 aa  59.7  3e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1370  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  30.43 
 
 
232 aa  59.7  4e-08  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.711039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2731  cobalamin biosynthesis protein CbiM  28.38 
 
 
250 aa  59.3  4e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.480074  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3660  cobalt transport protein CbiM  31.78 
 
 
225 aa  56.6  3e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4182  cobalt transport protein CbiM  27.48 
 
 
251 aa  56.6  3e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2333  cobalt transport protein CbiM  25.63 
 
 
235 aa  56.6  3e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0472  cobalt transport protein CbiM  29.39 
 
 
225 aa  55.8  4e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0031  cobalt transport protein CbiM  25.81 
 
 
212 aa  56.2  4e-07  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0560  cobalamin biosynthesis protein CbiM  32.86 
 
 
249 aa  55.5  7e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0580  cobalt transport protein CbiM  27.78 
 
 
229 aa  55.1  8e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0647937  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0882  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.19 
 
 
421 aa  54.7  1e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1044  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  25.76 
 
 
246 aa  53.9  2e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1351  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.19 
 
 
233 aa  53.1  3e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309906  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0391  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.71 
 
 
202 aa  52.8  4e-06  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.026574  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2291  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.58 
 
 
235 aa  52.8  4e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1929  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  29.6 
 
 
259 aa  52.4  5e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.88224  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0298  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.19 
 
 
213 aa  52.4  5e-06  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.306858  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1545  cobalt transport protein CbiM  30.23 
 
 
246 aa  52  6e-06  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.21341e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1292  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.35 
 
 
299 aa  52  8e-06  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.46518  normal  0.800906 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0380  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  51.6  1e-05  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2305  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  35.9 
 
 
210 aa  51.2  1e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0531  cobalt transport protein CbiM  29.6 
 
 
230 aa  51.2  1e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0062  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.73 
 
 
213 aa  51.2  1e-05  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000311798  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.06 
 
 
310 aa  50.1  2e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118647  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1200  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.51 
 
 
347 aa  50.1  2e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.028093  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1226  cobalt transport protein CbiM  30.22 
 
 
226 aa  49.7  3e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.415e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2184  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.15 
 
 
241 aa  49.7  4e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00256059 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0712  cobalamin biosynthesis protein CbiM  27.4 
 
 
235 aa  49.7  4e-05  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2033  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.83 
 
 
217 aa  49.3  4e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6032  membrane protein  28.9 
 
 
217 aa  49.3  5e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2352  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  29.49 
 
 
310 aa  48.9  6e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3820  cobalt transport protein CbiM  31.08 
 
 
249 aa  48.5  7e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2565  cobalt transport protein CbiM  27.78 
 
 
239 aa  48.5  7e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.779557  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0681  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  24.19 
 
 
333 aa  48.1  9e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2358  cobalt transport protein CbiM  27.27 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.372857 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0772  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.82 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0519153  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1266  cobalamin biosynthesis protein CbiM  28.04 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0743  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.82 
 
 
241 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2199  cobalt transport protein CbiM  27.27 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2145  cobalt transport protein CbiM  27.27 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2192  cobalt transport protein CbiM  27.27 
 
 
245 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2245  cobalt transport protein CbiM  27.27 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.112187 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1558  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.97 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1863  cobalt transport protein CbiM  27.71 
 
 
352 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.292788  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0486  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.44 
 
 
337 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1276  cobalamin biosynthesis protein CbiM  30.41 
 
 
246 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.44 
 
 
229 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2620  cobalt transport protein CbiM  29.11 
 
 
247 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1803  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.51 
 
 
352 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1241  cobalt transport protein CbiM  29.78 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.335474  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4058  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.34 
 
 
235 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815174  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2752  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  26.2 
 
 
354 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  28.5 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.29234  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0323  cobalt transport protein CbiM  37.12 
 
 
249 aa  45.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00019504  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1216  cobalt transport protein CbiM  25 
 
 
231 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>