240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2779 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  100 
 
 
357 aa  723    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  44.44 
 
 
265 aa  238  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  42.07 
 
 
277 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  48.89 
 
 
231 aa  220  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1342  Ion transport protein  42.64 
 
 
269 aa  212  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0543607  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0167  Ion transport protein  44.49 
 
 
273 aa  209  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.177755  normal  0.634812 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1005  Ion transport protein  44.92 
 
 
267 aa  190  4e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0408  cation channel family protein  40.64 
 
 
269 aa  184  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0387  Ion transport protein  40.64 
 
 
269 aa  180  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_351  cation channel protein  40.66 
 
 
269 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2771  Ion transport protein  42.4 
 
 
292 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.415569  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  39.51 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  39.09 
 
 
325 aa  173  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  35.9 
 
 
311 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21361  potassium channel, VIC family protein  38.5 
 
 
212 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.5958 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  29.55 
 
 
419 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2388  Ion transport protein  34.39 
 
 
302 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.56 
 
 
408 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.86 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  30.45 
 
 
412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  31.58 
 
 
409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0044  Ion transport 2 domain protein  37.07 
 
 
316 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1898  Ion transport protein  30.04 
 
 
308 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000138161 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1402  Ion transport protein  35.32 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0277452  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1941  Ion transport protein  34.32 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0124996 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1725  Ion transport protein  34.41 
 
 
292 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0536813  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4567  cyclic nucleotide-binding protein  34.38 
 
 
385 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0724971  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0600  Ion transport protein  37.85 
 
 
228 aa  136  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.90662  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1368  Kef-type K+ transporter NAD-binding component  30.45 
 
 
264 aa  136  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0288  Ion transport protein  32.3 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00471  hypothetical protein  30.42 
 
 
265 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  30.23 
 
 
276 aa  133  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03020  hypothetical protein  33.71 
 
 
282 aa  133  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1854  putative ion transport protein  35.34 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.807615  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3005  potassium channel protein  31.58 
 
 
272 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2209  Ion transport protein  30.34 
 
 
289 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2766  Ion transport protein  31.5 
 
 
279 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0676384  normal  0.308489 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2286  Ion transport protein  31.34 
 
 
289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.630315  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5285  Ion transport protein  29.62 
 
 
310 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2419  Ion transport protein  30.97 
 
 
289 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2112  ion transport protein  29.32 
 
 
295 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10571  potassium channel, VIC family protein  29.28 
 
 
259 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3452  Ion transport protein  36.84 
 
 
279 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0515  ion transport protein  33.88 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1821  ion transport protein  29.37 
 
 
279 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  31.47 
 
 
284 aa  125  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0253  Ion transport protein  30.99 
 
 
273 aa  125  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.614768  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2640  Ion transport protein  30.35 
 
 
284 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.512871  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2520  Ion transport protein  30.35 
 
 
284 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1557  Ion transport protein  29.1 
 
 
277 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1824  Ion transport protein  30.35 
 
 
284 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0249663  normal  0.467552 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2527  Ion transport protein  30.35 
 
 
284 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002929  possible potassium channel VIC family  32.45 
 
 
287 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000118679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2444  Ion transport protein  33.71 
 
 
271 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09508  potassium channel protein  33.56 
 
 
288 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.993518  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0040  Ion transport protein  29.6 
 
 
272 aa  122  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2281  Ion transport protein  30.83 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0091  Ion transport protein  30.2 
 
 
299 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1166  Ion transport protein  30.56 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1267  Ion transport protein  29.13 
 
 
305 aa  119  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.905498  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1660  potassium channel protein  27.59 
 
 
277 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.819465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3292  Ion transport protein  27.21 
 
 
290 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3836  putative potassium channel  28.8 
 
 
283 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122783  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1491  Ion transport protein  29.61 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45070  putative potassium channel  28.4 
 
 
283 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2036  ion transporter  32.74 
 
 
303 aa  115  8.999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000745091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2375  Ion transport protein  31.51 
 
 
276 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2579  hypothetical protein  28.06 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1991  potassium channel protein  31.65 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3225  Ion transport protein  28.98 
 
 
258 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2339  Ion transport protein  30.33 
 
 
276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0939  VIC family potassium channel protein  29.8 
 
 
276 aa  113  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.650828  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  35.22 
 
 
367 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1478  Ion transport protein  29.8 
 
 
276 aa  113  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.870774  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44535  predicted protein  27.43 
 
 
1283 aa  112  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.231791  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3630  Ion transport protein  28.74 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.334747  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4286  Ion transport protein  34.7 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361083  normal  0.259623 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3624  ion transport protein, putative  28.05 
 
 
277 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  28.46 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  31.67 
 
 
517 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1014  Ion transport protein  28.4 
 
 
276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000934363  hitchhiker  0.000116097 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4283  Ion transport protein  26.87 
 
 
285 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0210487  normal  0.0226615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1566  Ion transport protein  30.45 
 
 
273 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0452104  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3053  Ion transport protein  32 
 
 
288 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4304  cation transporter, voltage-gated ion channel cation transporter  30.45 
 
 
273 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  32.26 
 
 
531 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3869  Ion transport protein  30 
 
 
273 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.519934  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0564  Ion transport 2 domain protein  30.9 
 
 
276 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2791  Ion transport protein  30 
 
 
306 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1869  Ion transport protein  30.5 
 
 
278 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1932  Ion transport protein  30.5 
 
 
278 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595369  normal  0.0211569 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1404  Ion transport protein  30.5 
 
 
278 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1586  Ion transport protein  30.5 
 
 
278 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.580145  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1875  Ion transport protein  30.5 
 
 
278 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354062  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  27.84 
 
 
274 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0709  Ion transport protein  28.93 
 
 
295 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0236  Ion transport 2 domain protein  28.99 
 
 
256 aa  103  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02294  ion transporter  28.19 
 
 
290 aa  102  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6685  Ion transport protein  29.8 
 
 
273 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0929  Ion transport protein  31.1 
 
 
274 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.765221  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>