25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2721 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  100 
 
 
489 aa  969    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2998  hypothetical protein  27.08 
 
 
495 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  20.79 
 
 
444 aa  114  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  23.52 
 
 
483 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  24.38 
 
 
446 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  22.97 
 
 
487 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2886  hypothetical protein  20.59 
 
 
518 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770972  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2459  hypothetical protein  20 
 
 
518 aa  84  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.679548  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0126  hypothetical protein  22.25 
 
 
454 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0255441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3425  hypothetical protein  21.21 
 
 
511 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.955641  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6214  hypothetical protein  19.63 
 
 
544 aa  73.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1235  hypothetical protein  24.2 
 
 
488 aa  73.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.212609  normal  0.0713151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  22.97 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1964  hypothetical protein  19.8 
 
 
511 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611513  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2169  hypothetical protein  18.89 
 
 
513 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1664  hypothetical protein  21.1 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0854698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  19.76 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1393  hypothetical protein  22.2 
 
 
495 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000104621  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1196  hypothetical protein  21.15 
 
 
417 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  21.15 
 
 
417 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4086  hypothetical protein  20.63 
 
 
520 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0146157  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1274  hypothetical protein  23.12 
 
 
492 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000354045  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1366  hypothetical protein  20.79 
 
 
481 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  25.83 
 
 
468 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3372  hypothetical protein  21.96 
 
 
455 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.315393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>