More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2691 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  100 
 
 		 508 aa  1006    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  38.17 
 
 		 456 aa  254  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  36.33 
 
 		 446 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  28.3 
 
 		 495 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  28.09 
 
 		 495 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  28.43 
 
 		 492 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  36 
 
 		 454 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  36 
 
 		 384 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  27.4 
 
 		 478 aa  126  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  24.88 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  28.31 
 
 		 551 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  29.58 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  31.88 
 
 		 357 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  31.87 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  26.6 
 
 		 495 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  30.55 
 
 		 580 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  27.32 
 
 		 948 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  27.18 
 
 		 827 aa  99  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 869 aa  98.2  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  26.6 
 
 		 781 aa  95.1  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  29.56 
 
 		 919 aa  93.6  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  28.11 
 
 		 478 aa  93.6  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  30.5 
 
 		 920 aa  93.2  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  29.85 
 
 		 912 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  30.5 
 
 		 915 aa  91.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  30.85 
 
 		 828 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  28.1 
 
 		 351 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  31 
 
 		 921 aa  91.3  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  27.47 
 
 		 576 aa  90.9  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  28.68 
 
 		 803 aa  90.5  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  30 
 
 		 919 aa  90.5  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  25.71 
 
 		 1055 aa  90.1  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  28.88 
 
 		 931 aa  89.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  29 
 
 		 922 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  29.61 
 
 		 830 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  29.85 
 
 		 828 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  33.33 
 
 		 833 aa  88.6  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  29 
 
 		 910 aa  87.8  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  27.94 
 
 		 268 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  22.34 
 
 		 869 aa  85.9  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  30.31 
 
 		 264 aa  85.9  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 837 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 837 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 837 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  27.04 
 
 		 936 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  30.86 
 
 		 241 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  26.99 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 828 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  27.46 
 
 		 940 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  32.13 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  28.14 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  28.51 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  24.44 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  30.6 
 
 		 201 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  30.42 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  28.02 
 
 		 852 aa  76.6  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  27.95 
 
 		 869 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  28.46 
 
 		 791 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  29.02 
 
 		 830 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  28.64 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  29.14 
 
 		 823 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  28.89 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.89 
 
 		 348 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  34.43 
 
 		 243 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  25.96 
 
 		 812 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.89 
 
 		 351 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.89 
 
 		 348 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.89 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.89 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  25.91 
 
 		 379 aa  72  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  28.05 
 
 		 317 aa  72  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  27.11 
 
 		 387 aa  72  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  23.87 
 
 		 800 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  26.84 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  27.04 
 
 		 834 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  30.23 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  24.45 
 
 		 977 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  24.52 
 
 		 824 aa  70.5  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  25.56 
 
 		 897 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  27.89 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  27.89 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.89 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.89 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  29.38 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.89 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  27.89 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  27.89 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.89 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  24.54 
 
 		 952 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  27.43 
 
 		 373 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.27 
 
 		 920 aa  69.3  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  25.16 
 
 		 833 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  33.58 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.42 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  23.51 
 
 		 753 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  27.57 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  27.65 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  26.21 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>