35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2638 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2638  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  654    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.898598  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3548  hypothetical protein  60.37 
 
 
321 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00235957 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  28.63 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  21.99 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  24.38 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  22.71 
 
 
314 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  27.16 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  26.79 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  28.16 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  26.83 
 
 
340 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  19.71 
 
 
350 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  26.35 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  18.25 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  19.79 
 
 
328 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  20.5 
 
 
334 aa  55.8  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  20.52 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  21.19 
 
 
586 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  22.57 
 
 
336 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3900  hypothetical protein  26.53 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3213  hypothetical protein  27.55 
 
 
331 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  21.46 
 
 
297 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  23.78 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  23.59 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  20.65 
 
 
320 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  20.24 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  22.56 
 
 
319 aa  46.6  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  23.05 
 
 
338 aa  46.6  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  23.15 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  21.37 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  23.15 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  21.14 
 
 
378 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  28.17 
 
 
327 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  20.55 
 
 
378 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  21.62 
 
 
370 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  24.38 
 
 
326 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>