48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2634 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  100 
 
 
532 aa  1064    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  39.7 
 
 
517 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  37.13 
 
 
535 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  39.48 
 
 
526 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  39.49 
 
 
528 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  37.92 
 
 
546 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  38.72 
 
 
528 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  37.76 
 
 
533 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  37.19 
 
 
533 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  34.76 
 
 
546 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  34.46 
 
 
546 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  31.55 
 
 
547 aa  246  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  30.91 
 
 
543 aa  193  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  28.82 
 
 
569 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  31.36 
 
 
557 aa  83.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  32.57 
 
 
592 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  32.57 
 
 
592 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  26.85 
 
 
536 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  34.69 
 
 
531 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  30.64 
 
 
618 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  31.84 
 
 
516 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  31.34 
 
 
516 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  31.34 
 
 
516 aa  70.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  31.34 
 
 
516 aa  70.5  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  31.34 
 
 
516 aa  70.1  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  26.45 
 
 
605 aa  67  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
513 aa  67  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  26.99 
 
 
607 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  26.32 
 
 
531 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
483 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  31.11 
 
 
529 aa  60.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  34.35 
 
 
618 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2957  membrane protein-like protein  25.36 
 
 
729 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  28.79 
 
 
658 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  30.22 
 
 
534 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
510 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  24.78 
 
 
727 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  35.29 
 
 
492 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  24.71 
 
 
544 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1207  membrane protein-like protein  23.16 
 
 
507 aa  51.6  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1943  membrane protein-like protein  28.15 
 
 
726 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  29.14 
 
 
558 aa  48.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  22.82 
 
 
557 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  27.71 
 
 
563 aa  47.8  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  23.81 
 
 
616 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0633  membrane protein-like protein  28.03 
 
 
558 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566084  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  30.86 
 
 
506 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  23.33 
 
 
557 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>