96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2485 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2485  photosystem antenna protein-like  100 
 
 		 522 aa  1045    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2484  photosystem antenna protein-like  58.55 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.965644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2483  photosystem antenna protein-like  61.99 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0053  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  60.14 
 
 		 460 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000498494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0055  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  60.14 
 
 		 460 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1060  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  61.54 
 
 		 461 aa  350  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000366993  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0578  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  61.65 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0513  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  58.36 
 
 		 459 aa  342  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0656  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  59.35 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1243  photosynthetic II protein PsbC  61.67 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0217  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  58.01 
 
 		 473 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0294116  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1795  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  49.13 
 
 		 359 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08421  photosystem II PsbC protein (CP43)  53.09 
 
 		 464 aa  290  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1667  photosystem antenna protein-like  47.38 
 
 		 344 aa  289  8e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00889751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1993  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  52.63 
 
 		 462 aa  287  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0667  photosynthetic II protein PsbC  52.63 
 
 		 462 aa  287  4e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.329399  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1542  iron-stress chlorophyll-binding protein  46.65 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398653  normal  0.0103257 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0768  photosystem II PsbC protein (CP43)  51.94 
 
 		 460 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16081  photosystem II PsbC protein (CP43)  51.94 
 
 		 460 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.548682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12341  photosystem II PsbC protein (CP43)  52.46 
 
 		 460 aa  273  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.606702  normal  0.098859 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1257  photosystem II PsbC protein (CP43)  49.82 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0172037  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13251  photosystem II PsbC protein (CP43)  49.12 
 
 		 460 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  unclonable  0.000121028  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13351  photosystem II PsbC protein (CP43)  49.12 
 
 		 460 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13501  photosystem II PsbC protein (CP43)  49.12 
 
 		 460 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.151398  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2434  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  44.9 
 
 		 342 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000346716  hitchhiker  0.0000000117955 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1005  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  42.9 
 
 		 359 aa  252  9.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1590  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  42.12 
 
 		 345 aa  240  4e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10047  hitchhiker  0.00277314 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06931  light-harvesting complex protein  42.98 
 
 		 352 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06831  light-harvesting complex protein  42.69 
 
 		 352 aa  238  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06541  light-harvesting complex protein  42.69 
 
 		 352 aa  238  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0627  light-harvesting complex protein  40.69 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1271  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  38.4 
 
 		 352 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0702178  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06881  light-harvesting complex protein  38.62 
 
 		 349 aa  203  7e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0066  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbA  38.33 
 
 		 349 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09521  hypothetical protein  37.98 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722234 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13721  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  38.68 
 
 		 352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13631  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  38.68 
 
 		 352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13421  hypothetical protein  38.42 
 
 		 352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.233914  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08471  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  38 
 
 		 352 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.679252  hitchhiker  0.00174435 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0215  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  38 
 
 		 352 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07351  light-harvesting complex protein  36.78 
 
 		 351 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.112937 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10131  light-harvesting complex protein  41.26 
 
 		 350 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14531  hypothetical protein  36.03 
 
 		 355 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358475 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0722  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbE  32.68 
 
 		 362 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.683508  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15601  hypothetical protein  32.68 
 
 		 362 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.963648 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0719  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  36.24 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.17492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15561  hypothetical protein  36.24 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.95378 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14281  hypothetical protein  32.32 
 
 		 365 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517015 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11571  hypothetical protein  32.41 
 
 		 361 aa  170  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0991489 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17721  light-harvesting complex protein  35.12 
 
 		 368 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15611  hypothetical protein  33.43 
 
 		 354 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.732375  normal  0.917864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0723  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  33.43 
 
 		 354 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.543048  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0717  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbH  33.24 
 
 		 351 aa  160  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15541  hypothetical protein  33.24 
 
 		 351 aa  160  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11601  hypothetical protein  33.52 
 
 		 349 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0985613 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11631  hypothetical protein  34.26 
 
 		 352 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0312993 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0718  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbC  31.77 
 
 		 370 aa  156  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15551  hypothetical protein  31.77 
 
 		 370 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.203138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1204  photosystem I reaction center protein subunit XI  51.7 
 
 		 161 aa  143  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.667231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4474  photosystem I reaction center protein subunit XI  50.69 
 
 		 166 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1770  photosystem I reaction center protein subunit XI  49.3 
 
 		 159 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.685016 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2342  photosystem I reaction center protein subunit XI  55.15 
 
 		 166 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0220682  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4980  photosystem I reaction centre subunit XI PsaL  48.03 
 
 		 173 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00288068  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119502  photosystem I subunit XI precursor  43.71 
 
 		 209 aa  126  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.314666  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3982  photosystem I reaction centre subunit XI PsaL  52.99 
 
 		 164 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4024  photosystem I reaction centre subunit XI PsaL  52.99 
 
 		 164 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1476  photosystem I reaction center protein subunit XI  48.23 
 
 		 172 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000560958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17231  photosystem I reaction center protein subunit XI  42.68 
 
 		 199 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17111  photosystem I reaction center protein subunit XI  41.46 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0820263  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16991  photosystem I reaction center protein subunit XI  47.37 
 
 		 199 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16461  photosystem I reaction center protein subunit XI  48.51 
 
 		 199 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19591  photosystem I reaction center protein subunit XI  43.42 
 
 		 175 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.997991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1611  photosystem I reaction center protein subunit XI  47.45 
 
 		 196 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1084  photosystem I reaction center protein subunit XI  42.11 
 
 		 175 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0337  photosystem I reaction center protein subunit XI  46.32 
 
 		 163 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0293165 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1992  photosystem I reaction center protein subunit XI  43.97 
 
 		 163 aa  103  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104782  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23461  photosystem I reaction center protein subunit XI  44.37 
 
 		 187 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1194  photosystem I reaction centre subunit XI PsaL  56.63 
 
 		 216 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03471  photosystem II PsbB protein (CP47)  29.03 
 
 		 507 aa  90.9  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0321  photosystem II PsbB protein (CP47)  28.32 
 
 		 507 aa  90.5  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03401  photosystem II PsbB protein (CP47)  27.96 
 
 		 507 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03391  photosystem II PsbB protein (CP47)  27.96 
 
 		 507 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0452672  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1864  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  26.95 
 
 		 519 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0470  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  26.6 
 
 		 519 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22121  photosystem II PsbB protein (CP47)  26.69 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0697  photosystem II core light harvesting protein  30.37 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000016119  normal  0.0946335 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1692  photosystem II PsbB protein (CP47)  26.88 
 
 		 507 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0861  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  28.37 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000036456  decreased coverage  0.00000114007 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04051  photosystem II PsbB protein (CP47)  26.88 
 
 		 507 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.644071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3069  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  29.26 
 
 		 508 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3051  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  29.26 
 
 		 508 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000997071  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4666  photosystem antenna protein-like  27.63 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0622483  normal  0.0120025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1507  photosystem antenna protein-like  29.63 
 
 		 509 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000124352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1572  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  28.89 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4113  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  28.31 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03501  photosystem II PsbB protein (CP47)  26.9 
 
 		 518 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>