More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2342 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  100 
 
 		 156 aa  319  9.000000000000001e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  75.84 
 
 		 157 aa  238  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  71.15 
 
 		 155 aa  236  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  69.87 
 
 		 155 aa  235  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  71.33 
 
 		 155 aa  232  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  71.43 
 
 		 155 aa  223  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  71.43 
 
 		 155 aa  223  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  67.35 
 
 		 154 aa  218  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  61.18 
 
 		 161 aa  190  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  57.42 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  57.14 
 
 		 158 aa  185  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  55.56 
 
 		 161 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  55.19 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  56.16 
 
 		 150 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  56.08 
 
 		 153 aa  177  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  57.42 
 
 		 156 aa  177  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  52.53 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  55.63 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  55.26 
 
 		 157 aa  172  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  53.12 
 
 		 159 aa  171  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  54.25 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  54.73 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18051  SsrA-binding protein  54.86 
 
 		 165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0878615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  54 
 
 		 155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  52.38 
 
 		 152 aa  171  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  55.78 
 
 		 156 aa  171  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18261  SsrA-binding protein  53.42 
 
 		 164 aa  170  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.301941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 161 aa  170  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0117  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0117307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  54.11 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  54.19 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  52.7 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  52.9 
 
 		 154 aa  169  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  54.09 
 
 		 160 aa  168  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  54 
 
 		 155 aa  168  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18081  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.885662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  53.59 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1409  SsrA-binding protein  57.14 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000709702  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  55.17 
 
 		 161 aa  167  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  51.95 
 
 		 155 aa  167  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  52.03 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  52.03 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  54.05 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  52.03 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  57.14 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1193  SsrA-binding protein  50.66 
 
 		 165 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0161  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 167 aa  165  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1709  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  55.33 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  52.29 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17411  SsrA-binding protein  51.66 
 
 		 166 aa  164  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  51.3 
 
 		 154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  52.38 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  56.13 
 
 		 165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  52 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  56.55 
 
 		 157 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1996  SsrA-binding protein  52.7 
 
 		 175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  53.06 
 
 		 155 aa  164  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20681  SsrA-binding protein  50.67 
 
 		 165 aa  163  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.44969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  52.56 
 
 		 157 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1424  SsrA-binding protein  54.17 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  hitchhiker  0.00854817 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  52.35 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  52.26 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  52.26 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  51.3 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  51.3 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  51.3 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  51.3 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  51.3 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  51.3 
 
 		 155 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  49.67 
 
 		 155 aa  161  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  51.3 
 
 		 155 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01921  SsrA-binding protein  51.75 
 
 		 165 aa  160  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  50.65 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 154 aa  160  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5309  SsrA-binding protein  54.55 
 
 		 148 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0732663  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  53.1 
 
 		 155 aa  160  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  52.05 
 
 		 159 aa  160  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  52.7 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2757  SsrA-binding protein  50.32 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  50.65 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  49.04 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  56.52 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2153  SsrA-binding protein  49.36 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2019  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1901  SsrA-binding protein  53.85 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.673502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2005  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 185 aa  158  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0231332  normal  0.713632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>